RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520348.5

SNHG6-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG6, Length 648 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG6-201ENST00000520348 RFKQ969G6 155 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ZBTB8AQ96BR9 441 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 PLEKHA8Q96JA3 519 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 DOK1Q99704 481 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 JAM3Q9BX67 310 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 LHPPQ9H008 270 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 FAM186AA6NE01 2351 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 MPDZO75970 2070 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 M0R3G1 203 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 EFNA2O43921 213 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 AHSA1O95433 338 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 CD14P08571 375 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 HK1P19367 917 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 SLC2A5P22732 501 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 DCKP27707 260 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 RAB40BQ12829 278 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 MFSD13AQ14CX5 517 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 TGIF1Q15583 401 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 MDGA2Q7Z553 956 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 OR4K17Q8NGC6 315 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 MOSPD2Q8NHP6 518 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 LGALS12Q96DT0 336 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 CCDC182A6NF36 153 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 TRIM64BA6NI03 449 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 RIIAD1A6NNX1 92 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 INMTO95050 263 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 IFNGP01579 166 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 IGHMP01871 453 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ADORA3P0DMS8 318 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF3P17036 446 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 AQP2P41181 271 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 MAP2K4P45985 399 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 RPS5P46782 204 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 MLLT10P55197 1068 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 CDH11P55287 796 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ITGADQ13349 1161 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 KLHL22Q53GT1 634 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ALG10Q5BKT4 473 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 EMC4Q5J8M3 183 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 CPOQ8IVL8 374 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 STX19Q8N4C7 294 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 SCAIQ8N9R8 606 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 PSD4Q8NDX1 1056 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 OR5J2Q8NH18 312 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 THAP4Q8WY91 577 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 RORBQ92753 470 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 CRELD1Q96HD1 420 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 TMEM80Q96HE8 168 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 FANCFQ9NPI8 374 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 VDAC3Q9Y277 283 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 NPIPB13A6NJU9 1138 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 NPIPB4C9JG80 1138 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 H3BSA7 217 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 J3QRE1 110 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF17P17021 662 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 CCNA2P20248 432 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 MTNR1AP48039 350 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 CYB561P49447 251 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ZP4Q12836 540 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 SELENBP1Q13228 472 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 CRMP1Q14194 572 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms