RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514705.5

TSPAN17-208, Transcript of tetraspanin 17, human

TSL 2

Gene TSPAN17, Length 4,445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN17-208	ENST00000514705	SDF2	Q99470	211 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	STARD5	Q9NSY2	213 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705		A0A1W2PQU0	124 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	DNASE1L1	P49184	302 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	GPNMB	Q14956	572 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	SCMH1	Q96GD3	660 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	TREM1	Q9NP99	234 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705		A0A0A6YYD5	115 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM72	A0PK05	275 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	C11orf98	E9PRG8	122 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC25A12	O75746	678 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	UBL4A	P11441	157 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	CCKBR	P32239	447 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705		Q6ZTK2	550 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	PTPRD	P23468	1912 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705		A0A1B0GWA3	101 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	CD2	P06729	351 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	GNAL	P38405	381 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	CAPZA2	P47755	286 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	DUSP2	Q05923	314 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	ST8SIA2	Q92186	375 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	TTC9	Q92623	222 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	GHITM	Q9H3K2	345 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	MBD2	Q9UBB5	411 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	CD207	Q9UJ71	328 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	KAT7	O95251	611 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	PVR	P15151	417 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	MMP15	P51511	669 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	AMY2A	P04746	511 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	CPM	P14384	443 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	FOSL2	P15408	326 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	EOGT	Q5NDL2	527 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR2T4	Q8NH00	348 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	HPF1	Q9NWY4	346 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	LINC00862	A6NCI5	91 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705		H3BUI4	141 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR2T7	P0C7T2	308 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	TYRP1	P17643	537 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	CTXN1	P60606	82 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	BDH1	Q02338	343 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	SQSTM1	Q13501	440 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	CAMK2D	Q13557	499 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	KLHL26	Q53HC5	615 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	C12orf40	Q86WS4	652 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR2T27	Q8NH04	317 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	LINC00052	Q96N35	136 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	POMT2	Q9UKY4	750 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	PATJ	Q8NI35	1801 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705		H7C1C5	153 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRSS3	P35030	304 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	LCN6	P62502	163 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	LTB	Q06643	244 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	LINC00303	Q3SY05	128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	SEC22A	Q96IW7	307 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	GPR137	Q96N19	417 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	ARHGDIG	Q99819	225 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TSPAN17-208	ENST00000514705	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36

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