RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	VEGFC	P49767	419 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF84	P51523	738 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HCCS	P53701	268 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CDK10	Q15131	360 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ARL14	Q8N4G2	192 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	BMF	Q96LC9	184 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	MRI1	Q9BV20	369 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RARRES3	Q9UL19	164 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193		H7C417	338 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CSF1	P09603	554 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GNRHR	P30968	328 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HOXC12	P31275	282 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FABP5	Q01469	135 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF616	Q08AN1	781 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	BAK1	Q16611	211 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	UEVLD	Q8IX04	471 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TOMM40L	Q969M1	308 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RASD2	Q96D21	266 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR5B2	Q96R09	309 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	UPK1A	O00322	258 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CD160	O95971	181 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ELK1	P19419	428 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	EMP3	P54852	163 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RAB38	P57729	211 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZP2	Q05996	745 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CD300C	Q08708	224 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	LCN10	Q6JVE6	187 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR7G2	Q8NG99	324 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ALG14	Q96F25	216 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ASB16	Q96NS5	453 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CRB3	Q9BUF7	120 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DAPP1	Q9UN19	280 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	MAN2B1	O00754	1011 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CHP2	O43745	196 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RAD51D	O75771	328 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PET100	P0DJ07	73 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NID1	P14543	1247 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PRPH2	P23942	346 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CASR	P41180	1078 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DPT	Q07507	201 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GPR176	Q14439	515 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ACBD4	Q8NC06	268 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PHB2	Q99623	299 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	MAP3K3	Q99759	626 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	AGPAT2	O15120	278 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	IL33	O95760	270 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	EMP2	P54851	167 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	IL13RA1	P78552	427 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SELENBP1	Q13228	472 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		7.45	□□□□□ -1.22

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