RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508029.5

NSD1-208, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 1, human

TSL 2

Gene NSD1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSD1-208	ENST00000508029	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD1-208	ENST00000508029	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD1-208	ENST00000508029	TRIM2	Q9C040	744 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD1-208	ENST00000508029	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD1-208	ENST00000508029	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD1-208	ENST00000508029	C12orf10	Q9HB07	376 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD1-208	ENST00000508029	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD1-208	ENST00000508029	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD1-208	ENST00000508029	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	EVPLL	A8MZ36	301 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	FRS3	O43559	492 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	FZD7	O75084	574 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	RAD51D	O75771	328 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	AKR7A3	O95154	331 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	ITGA5	P08648	1049 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	CDK6	Q00534	326 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	BNIP2	Q12982	314 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	BOD1	Q96IK1	185 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	UPB1	Q9UBR1	384 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	VPS13C	Q709C8	3753 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	SHISA9	B4DS77	424 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	PTAFR	P25105	342 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	P2RY4	P51582	365 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	ATP5J2	P56134	94 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	TGFBR3	Q03167	851 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	TMEM225	Q6GV28	225 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	AAED1	Q7RTV5	226 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	KRT73	Q86Y46	540 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	NFKBID	Q8NI38	313 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	NEUROG1	Q92886	237 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	RASD1	Q9Y272	281 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029		H7C1Q1	480 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	ABCD4	O14678	606 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	AHSA1	O95433	338 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	HEXA	P06865	529 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	SOD3	P08294	240 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	MPG	P29372	298 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	EGR4	Q05215	589 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	ETFDH	Q16134	617 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	PGGHG	Q32M88	737 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	C10orf111	Q8N326	155 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	DPP10	Q8N608	796 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	OR52N5	Q8NH56	324 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	SMR3A	Q99954	134 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	OR2T1	O43869	369 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	SERPINB7	O75635	380 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	PAX7	P23759	505 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	SLC6A2	P23975	617 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	CD40	P25942	277 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NSD1-208	ENST00000508029	SCARB2	Q14108	478 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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