RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486810.5

COPS3-209, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene COPS3, Length 938 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-209ENST00000486810 AGAP20933 346 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 PRPH2P23942 346 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 PTPN3P26045 913 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 STOMP27105 288 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 CST5P28325 142 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 IL12BP29460 328 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 SERPINA4P29622 427 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 GNRHRP30968 328 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 DNA2P51530 1060 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 TDGF1P3P51864 188 aa4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 TAS2R39P59534 338 aa4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 MAPK11Q15759 364 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 LRRC26Q2I0M4 334 aa4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 CARD17Q5XLA6 110 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 KMT5CQ86Y97 462 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 ZNF573Q86YE8 665 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 MMP21Q8N119 569 aa4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 OR51D1Q8NGF3 324 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 OR5R1Q8NH85 324 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 TERB2Q8NHR7 220 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 CD200R1Q8TD46 325 aa4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 PRAP1Q96NZ9 151 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 RBP7Q96R05 134 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 RBBP8Q99708 897 aa4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 CITED1Q99966 193 aa4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 SLC35A5Q9BS91 424 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 ABCB9Q9NP78 766 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 DDIT4Q9NX09 232 aa4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 GSKIPQ9P0R6 139 aa4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 ICKQ9UPZ9 632 aa4.96□□□□□ -1.62
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COPS3-209ENST00000486810 TEX264Q9Y6I9 313 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 PRSS21Q9Y6M0 314 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 AGLP35573 1532 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 TANC1Q9C0D5 1861 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 KIF1AQ12756 1690 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 TSPOAP1O95153 1857 aa4.95□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 TRAV25A0A0B4J276 109 aa4.95□□□□□ -1.62
COPS3-209ENST00000486810 A0A1B0GUH1 482 aa4.95□□□□□ -1.62
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