RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478658.1

USF3-202, Transcript of upstream transcription factor family member 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene USF3, Length 8,461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF3-202ENST00000478658 AKTIPQ9H8T0 292 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 TMEM140Q9NV12 185 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 FAM170BA6NMN3 283 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 B4DGG1 531 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 RPP14O95059 124 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 CD79AP11912 226 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 SEMA3BQ13214 749 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 GPR50Q13585 617 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 GLYATL3Q5SZD4 288 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 DESI1Q6ICB0 168 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 DTX1Q86Y01 620 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 FAM219AQ8IW50 185 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 RNF157Q96PX1 679 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 OR7D2Q96RA2 312 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 SMOQ99835 787 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 TMEM175Q9BSA9 504 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 EBPLQ9BY08 206 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 LY9Q9HBG7 655 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 SLC22A13Q9Y226 551 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 CBY3A6NI87 242 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 PRRG2O14669 202 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 PTTG1O95997 202 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 PLPP4Q5VZY2 271 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 DTX2Q86UW9 622 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 FAM26EQ8N5C1 309 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 C3orf58Q8NDZ4 430 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 KLK14Q9P0G3 267 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 CHD5Q8TDI0 1954 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 PEX11AO75192 247 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 LCATP04180 440 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 CNR1P21554 472 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 RTP1P59025 263 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 ZNF141Q15928 474 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 OGFOD3Q6PK18 319 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 ZNF595Q8IYB9 648 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 RHOXF1Q8NHV9 184 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 APOLD1Q96LR9 279 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 METTL9Q9H1A3 318 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 CTPS2Q9NRF8 586 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 PIAS2O75928 621 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 CD1BP29016 333 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 PCGF2P35227 344 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 PBX1P40424 430 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 MFAP4P55083 255 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 GPR17Q13304 367 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 AADACL3Q5VUY0 350 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 TMPRSS12Q86WS5 348 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 OR4F17Q8NGA8 305 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 OR10AD1Q8NGE0 317 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 OR4F5Q8NH21 305 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 C1orf74Q96LT6 269 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 OR4F4Q96R69 305 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 GHITMQ9H3K2 345 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 SIX2Q9NPC8 291 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 OXSMQ9NWU1 459 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa5.09□□□□□ -1.59
USF3-202ENST00000478658 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.09□□□□□ -1.6
USF3-202ENST00000478658 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa5.09□□□□□ -1.6
USF3-202ENST00000478658 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
USF3-202ENST00000478658 C1orf226A1L170 272 aa5.09□□□□□ -1.6
USF3-202ENST00000478658 TMEM200CA6NKL6 621 aa5.09□□□□□ -1.6
USF3-202ENST00000478658 EMC8O43402 210 aa5.09□□□□□ -1.6
USF3-202ENST00000478658 MMP20O60882 483 aa5.09□□□□□ -1.6
USF3-202ENST00000478658 TUSC2O75896 110 aa5.09□□□□□ -1.6
USF3-202ENST00000478658 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
USF3-202ENST00000478658 NELFEP18615 380 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
USF3-202ENST00000478658 DPP4P27487 766 aa5.09□□□□□ -1.6
USF3-202ENST00000478658 SSTR2P30874 369 aa5.09□□□□□ -1.6
USF3-202ENST00000478658 AKR1C3P42330 323 aa5.09□□□□□ -1.6
USF3-202ENST00000478658 ETV1P50549 477 aa5.09□□□□□ -1.6
USF3-202ENST00000478658 EMP3P54852 163 aa5.09□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms