RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	CASP12	Q6UXS9	341 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	BEND4	Q6ZU67	534 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC80	Q76M96	950 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	ELOA3	Q8NG57	546 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	MCHR1	Q99705	422 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRGBP	Q9NV56	204 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	EMC3	Q9P0I2	261 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	AKAP9	Q99996	3911 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPG11	Q96JI7	2443 aa		9.83	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	DYNC1I1	O14576	645 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC22	O60826	627 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPPA	P01160	153 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	BGLAP	P02818	100 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	FUT4	P22083	530 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUDT2	P50583	147 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	LTB	Q06643	244 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q6ZT83	130 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	STK32C	Q86UX6	486 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	MICU2	Q8IYU8	434 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR2T12	Q8NG77	320 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF217	Q8TC41	542 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	STK35	Q8TDR2	534 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAAR8	Q969N4	342 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIM2	Q9C040	744 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	C12orf10	Q9HB07	376 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	GID8	Q9NWU2	228 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	MALT1	Q9UDY8	824 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A087WUJ7	227 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	GMNC	A6NCL1	334 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959		M0R082	166 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLF4	O43474	513 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAD51D	O75771	328 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	HPR	P00739	348 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLAU	P00749	431 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	ITGA5	P08648	1049 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	GRPR	P30550	384 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAP2K6	P52564	334 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	LIPE	Q05469	1076 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	VEZF1	Q14119	521 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAB1	Q15750	504 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	ULK3	Q6PHR2	472 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPAT4	Q86UL3	456 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	CARM1	Q86X55	608 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	KDM8	Q8N371	416 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC38A4	Q969I6	547 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM45B	Q96B21	275 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	APH1A	Q96BI3	265 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms