RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474409.1

CNN3-205, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CNN3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-205ENST00000474409 ZNF74Q16587 644 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 HBMQ6B0K9 141 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 FAHD1Q6P587 224 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 GALNT5Q7Z7M9 940 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 GGNQ86UU5 652 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 SIAH3Q8IW03 269 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 GHDCQ8N2G8 530 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 TAAR8Q969N4 342 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 SARAFQ96BY9 339 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 WBP1Q96G27 269 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 GPR137Q96N19 417 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 MOGAT1Q96PD6 335 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 POTEKPQ9BYX7 375 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 UCK2Q9BZX2 261 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 FKRPQ9H9S5 495 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 USE1Q9NZ43 259 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 ENOPH1Q9UHY7 261 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 ZNF229Q9UJW7 825 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 CAMK2AQ9UQM7 478 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.5□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 SPTA1P02549 2419 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 A0A0J9YW62 118 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 A0A1B0GTH9 108 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 LIPT2A6NK58 231 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 NPIPA2E9PIF3 369 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 NPIPA3F8WFD2 350 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 M0R082 166 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 CDC42EP2O14613 210 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 CXCL13O43927 109 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 OR6A2O95222 327 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 GASTP01350 101 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 ALPLP05186 524 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 IMPDH2P12268 514 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 ABOP16442 354 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 ZNF708P17019 499 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 FUT1P19526 365 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 GRPRP30550 384 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 GSSP48637 474 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 DIO1P49895 249 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 DAPP51397 102 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 CLDN18P56856 261 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 SLC35A1P78382 337 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 SGCBQ16585 318 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 RFX4Q33E94 735 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 GXYLT1Q4G148 440 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 VASNQ6EMK4 673 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 PCSK4Q6UW60 755 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 TMPPEQ6ZT21 453 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 OAFQ86UD1 273 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 SCAIQ8N9R8 606 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 OR5J2Q8NH18 312 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 OR6S1Q8NH40 331 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 OR51A7Q8NH64 312 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 OR10D3Q8NH80 312 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 MFSD8Q8NHS3 518 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 FAR1Q8WVX9 515 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 NRG4Q8WWG1 115 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 MIB2Q96AX9 1013 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 SLC29A1Q99808 456 aa7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CNN3-205ENST00000474409 CHST11Q9NPF2 352 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms