RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTNSO60931 367 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEC22BO75396 215 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NME6O75414 186 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEACAM4O75871 244 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRATO95237 230 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERPINA7P05543 415 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNNI3P19429 210 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL10P22301 178 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SOAT1P35610 550 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FEN1P39748 380 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RASSF2P50749 326 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSD17B7P56937 341 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC26A5P58743 744 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL38P63173 70 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GAGE2BQ13066 116 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GAGE2EQ4V326 116 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6ZSR9 355 aa7.6□□□□□ -1.19
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF843Q8N446 348 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C16orf78Q8WTQ4 265 aa7.6□□□□□ -1.19
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNK13Q9HB14 408 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.6□□□□□ -1.19
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa7.6□□□□□ -1.19
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 C5orf52A6NGY3 159 aa7.59□□□□□ -1.19
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 C17orf105B2RV13 164 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM114B3SHH9 223 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF814B7Z6K7 855 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.59□□□□□ -1.19
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 RGS14O43566 566 aa7.59□□□□□ -1.19
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERVK-8P63133 956 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF33BQ06732 778 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE2V1Q13404 147 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LTB4RQ15722 352 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EFNB3Q15768 340 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR52E8Q6IFG1 317 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NOXRED1Q6NXP6 359 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRLF3Q8IUI8 442 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLYBLQ8N0X4 340 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AGAP4Q96P64 663 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSSK3Q96PN8 268 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF747Q9BV97 191 aa7.59□□□□□ -1.19
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANKRA2Q9H9E1 313 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDR41Q9HAD4 459 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERVK-19Q9WJR5 959 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC28A1O00337 649 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDPCPO95876 746 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RLN1P04808 185 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FGF4P08620 206 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CT62P0C5K7 136 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SDC1P18827 310 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NT5EP21589 574 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERPINB5P36952 375 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 P2RX3P56373 397 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAA20P61599 178 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C2orf80Q0P641 193 aa7.58□□□□□ -1.2
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