RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454716.1

RPS3AP53-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 53, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP53, Length 778 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF595Q8IYB9 648 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 LIX1Q8N485 282 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 TBC1D19Q8N5T2 526 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 MORN4Q8NDC4 146 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRPV3Q8NET8 790 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 OR10G3Q8NGC4 313 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 DOK4Q8TEW6 326 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 PAQR8Q8TEZ7 354 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF721Q8TF20 911 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 MS4A6EQ96DS6 147 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 PERPQ96FX8 193 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 LINC00479Q96M42 142 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 PIP5K1AQ99755 562 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 AIF1LQ9BQI0 150 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 ACKR4Q9NPB9 350 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 IKZF3Q9UKT9 509 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC6A5Q9Y345 797 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 A0A1B0GVY2 172 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 LRIT2A6NDA9 550 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 AP3B1O00203 1094 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 ERI3O43414 337 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 CTNSO60931 367 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 CRLF1O75462 422 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 GOSR1O95249 250 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 ETHE1O95571 254 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 ACSL3O95573 720 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 HIST1H2ADP20671 130 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 GDF1P27539 372 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 OPRM1P35372 400 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 RGS4P49798 205 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 PLA2G16P53816 162 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 CCNG2Q16589 344 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC22A10Q63ZE4 541 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 ADNP2Q6IQ32 1131 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 CDC73Q6P1J9 531 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 KIAA1328Q86T90 577 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 LUZP2Q86TE4 346 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 C9orf40Q8IXQ3 194 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 SYCE1Q8N0S2 351 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 RASGEF1CQ8N431 466 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 OR5L2Q8NGL0 311 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 OR1J2Q8NGS2 313 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 OR8K3Q8NH51 312 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 SMPDL3BQ92485 455 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 RUNDC3BQ96NL0 473 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 DACH2Q96NX9 599 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 CCL19Q99731 98 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 PIGQQ9BRB3 760 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 DOHHQ9BU89 302 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 UGT2B28Q9BY64 529 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 TSGA10Q9BZW7 698 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 RAD21L1Q9H4I0 556 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 PELI2Q9HAT8 420 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 QPCTLQ9NXS2 382 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 TAS2R13Q9NYV9 303 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 FBXO5Q9UKT4 447 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC22A14Q9Y267 594 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 WIF1Q9Y5W5 379 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 SERINC4A6NH21 518 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 SDR42E2A6NKP2 422 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 DEFB108AA8MXU0 73 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 GOLGA8MH3BSY2 632 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRAPPC6AO75865 159 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 SEC14L2O76054 403 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 C1QAP02745 245 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 IGKV3-11P04433 115 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 GNAZP19086 355 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLCO1A2P46721 670 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 CDK9P50750 372 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 AP1S2P56377 157 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 KCNJ10P78508 379 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms