RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 LRIG1Q96JA1 1093 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TREM1Q9NP99 234 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP350Q5VT06 3117 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ARGFXA6NJG6 315 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM183AA6NL82 134 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 COLCA2A8K830 154 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SOCS6O14544 535 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 RLN1P04808 185 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CTSAP10619 480 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCD3P28288 659 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 STAT5AP42229 794 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CAMLGP49069 296 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 RPE65Q16518 533 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF805Q5CZA5 627 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF546Q86UE3 836 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5D16Q8NGK9 328 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 LGALS14Q8TCE9 139 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC38A5Q8WUX1 472 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PAAF1Q9BRP4 392 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 FNDC11Q9BVV2 318 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 POLE3Q9NRF9 147 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 IL17CQ9P0M4 197 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 MOKQ9UQ07 419 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 A4D1N5 150 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SC5DO75845 299 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 NTN1O95631 604 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 NQO2P16083 231 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 GALP22466 123 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 HTR2AP28223 471 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 NSG1P42857 185 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CSNK1DP48730 415 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TSSK4Q6SA08 328 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF614Q8N883 585 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6K2Q8NGY2 324 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5W2Q8NH69 310 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ABHD4Q8TB40 342 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 RFKQ969G6 155 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 C14orf79Q96F83 325 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM19Q96HH6 336 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ALG8Q9BVK2 526 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM2Q9C040 744 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OR51I1Q9H343 314 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CNIH4Q9P003 139 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 A4GNTQ9UNA3 340 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ASF1AQ9Y294 204 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OR14I1A6ND48 311 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 STX11O75558 287 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC2A10O95528 541 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SOD2P04179 222 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP1B1P05026 303 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CA3P07451 260 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ABOP16442 354 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 BMI1P35226 326 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 GATMP50440 423 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 HCCSP53701 268 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PNLIPRP2P54317 469 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CASP6P55212 293 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SKP2Q13309 424 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 NFATC2Q13469 925 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 GPM6BQ13491 265 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT33BQ14525 404 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ADIPOQQ15848 244 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CSRP2Q16527 193 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 RPTNQ6XPR3 784 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CERS6Q6ZMG9 384 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CAMKMTQ7Z624 323 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 COMTD1Q86VU5 262 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB7BQ96AH8 199 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms