RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438265.5

RPE-211, Transcript of ribulose-5-phosphate-3-epimerase, humanhuman

TSL 3

Gene RPE, Length 668 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE-211ENST00000438265 UBQLNLQ8IYU4 475 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OR52E4Q8NGH9 312 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SMPDL3BQ92485 455 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TAMM41Q96BW9 452 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 STARD4Q96DR4 205 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 NSL1Q96IY1 281 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 MPP4Q96JB8 637 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 MUC13Q9H3R2 512 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ADPRHL2Q9NX46 363 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SELENONQ9NZV5 590 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TMED7Q9Y3B3 224 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.37□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SULT2B1O00204 365 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CXCR6O00574 342 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TNFSF11O14788 317 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 MSTNO14793 375 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CHP2O43745 196 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OR2T1O43869 369 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CXCL13O43927 109 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TPST1O60507 370 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 GMNNO75496 209 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 GOSR1O95249 250 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PLAUP00749 431 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CGAP01215 116 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 GPIP06744 558 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 THBDP07204 575 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 GKN3PP0CG01 181 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CD8BP10966 210 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 GGT1P19440 569 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 IFNA8P32881 189 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SFTPDP35247 375 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 DIO1P49895 249 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CRYBA2P53672 197 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SLC16A1P53985 500 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SELENOWP63302 87 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SLC35A1P78382 337 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SORDQ00796 357 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 BNIP2Q12982 314 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 MTX3Q5HYI7 312 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CBLL1Q75N03 491 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 FCRLAQ7L513 359 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 HMGN2P46Q86SG4 172 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 FNDC9Q8TBE3 224 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PIGXQ8TBF5 258 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OSTF1Q92882 214 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SLC38A4Q969I6 547 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ZNF524Q96C55 264 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OR5B2Q96R09 309 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 EPYCQ99645 322 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 MDFIQ99750 246 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TMEM43Q9BTV4 400 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SLC19A3Q9BZV2 496 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 GORASP2Q9H8Y8 452 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 BCO1Q9HAY6 547 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 FANCFQ9NPI8 374 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 EMC3Q9P0I2 261 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 RPS6KA6Q9UK32 745 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PLCE1Q9P212 2302 aa7.36□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 A0A087WUJ7 227 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 A0A1B0GWA3 101 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TMEM72A0PK05 275 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TRAPPC13A5PLN9 417 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TRIM64BA6NI03 449 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ZNF724A8MTY0 619 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 GPR171O14626 319 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 GSTA4O15217 222 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 FRS3O43559 492 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CYTIPO60759 359 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms