RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.04□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 GPR148Q8TDV2 347 aa6.04□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.04□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 TEX37Q96LM6 180 aa6.04□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ACPTQ9BZG2 426 aa6.04□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 LTB4R2Q9NPC1 389 aa6.04□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 A0A1W2PR64 198 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 A0A1W2PRV1 198 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ITPKBP27987 946 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 SLC10A1Q14973 349 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 NIPAL3Q6P499 406 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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SBNO1-202ENST00000420886 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.03□□□□□ -1.44
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SBNO1-202ENST00000420886 LAMP1P11279 417 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 GSK3AP49840 483 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 XKR7Q5GH72 579 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM107Q6UX40 140 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 TGM7Q96PF1 710 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 TEX101Q9BY14 249 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ALPK3Q96L96 1907 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 MAFKO60675 156 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 MT-CO2P00403 227 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 CAV2P51636 162 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 LILRA4P59901 499 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 CES4AQ5XG92 561 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 MDGA2Q7Z553 956 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 SULF2Q8IWU5 870 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 TMED6Q8WW62 240 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 C1orf74Q96LT6 269 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 LRP5LA4QPB2 252 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 IRAK2O43187 625 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ABLIM3O94929 683 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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SBNO1-202ENST00000420886 USP21Q9UK80 565 aa6.03□□□□□ -1.44
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SBNO1-202ENST00000420886 DGCR2P98153 550 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.03□□□□□ -1.44
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SBNO1-202ENST00000420886 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM19Q96HH6 336 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 KIRREL1Q96J84 757 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 CASD1Q96PB1 797 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 TDP1Q9NUW8 608 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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