RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 UGT1A9O60656 530 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFSF13O75888 250 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 AP2A1O95782 977 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 MOSP00540 346 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 MMP1P03956 469 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 ICAM2P13598 275 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 GLP1RP43220 463 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 CSNK1DP48730 415 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 PKNOX1P55347 436 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 DLX1P56177 255 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 KLRC3Q07444 240 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 GANABQ14697 944 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC15A2Q16348 729 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 PARP15Q460N3 678 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKDD1AQ495B1 522 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM225Q6GV28 225 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 COX15Q7KZN9 410 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF429Q86V71 674 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC50Q8IVM0 306 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC35F2Q8IXU6 374 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 MDS2Q8NDY4 140 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 OR6C4Q8NGE1 309 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 ARPC1AQ92747 370 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF185Q96GF1 192 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC25Q96NG3 672 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF607Q96SK3 696 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 NAT9Q9BTE0 207 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB34Q9BZG1 259 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 NT5C3AQ9H0P0 336 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRN3Q9H3W5 708 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 EXTL2Q9UBQ6 330 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB26Q9ULW5 256 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 COPS3Q9UNS2 423 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 WSB1Q9Y6I7 421 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 IKBKGQ9Y6K9 419 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 AGPAT2O15120 278 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 ARPC3O15145 178 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 OPN1MWP04001 364 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 IGKV3-11P04433 115 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 GIPP09681 153 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 OPN1MW2P0DN77 364 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 OPN1MW3P0DN78 364 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 DDOSTP39656 456 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 VGLL4Q14135 290 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf220Q5T0J3 134 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 CTRB2Q6GPI1 263 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 C6orf89Q6UWU4 347 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC65Q8IXS2 484 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 TBC1D21Q8IYX1 336 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF786Q8N393 782 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 IPMKQ8NFU5 416 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 OR9G1Q8NH87 305 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 MARCH1Q8TCQ1 289 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 MAIP1Q8WWC4 291 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 RLN3Q8WXF3 142 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 CMTM7Q96FZ5 175 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 TIMD4Q96H15 378 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 FCRL1Q96LA6 429 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 ERP44Q9BS26 406 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 CRACR2AQ9BSW2 395 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 RBKSQ9H477 322 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 REEP4Q9H6H4 257 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 UFSP2Q9NUQ7 469 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXC10Q9NYD6 342 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 SNX6Q9UNH7 406 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 RABL2BQ9UNT1 228 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 NACAE9PAV3 2078 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0G2JN53 185 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 TPM2P07951 284 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC130P13994 396 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CRISP2P16562 243 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PCMT1P22061 227 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 FMO3P31513 532 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CASP4P49662 377 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 EFNB2P52799 333 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC74AQ0VAA2 488 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ASPHQ12797 758 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 OXA1LQ15070 435 aa2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms