RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.79□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZT83 130 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 PIGXQ8TBF5 258 aa6.79□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.79□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.79□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.79□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 PRKAR1BP31321 381 aa6.78□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC16A1P53985 500 aa6.78□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC35A1P78382 337 aa6.78□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 ACKR1Q16570 336 aa6.78□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.78□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.78□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 NANOGQ9H9S0 305 aa6.78□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.78□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.78□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.78□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.78□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 PLCE1Q9P212 2302 aa6.78□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 FBN3Q75N90 2809 aa6.77□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 FBP2O00757 339 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 GPR171O14626 319 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 AIM2O14862 343 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 FRS3O43559 492 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 RAMP1O60894 148 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SMPD2O60906 423 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PGM3O95394 542 aa6.77□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 C8BP07358 591 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 IMPDH2P12268 514 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 IDUAP35475 653 aa6.77□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 MTPNP58546 118 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 NCALDP61601 193 aa6.77□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 STK11Q15831 433 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 Q5PR19 223 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 C16orf89Q6UX73 402 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CASP12Q6UXS9 341 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.77□□□□□ -1.33
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