RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 RANBP10Q6VN20 620 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR2W3Q7Z3T1 314 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF280BQ86YH2 543 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF695Q8IW36 515 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PQLC3Q8N755 202 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR52B6Q8NGF0 335 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR1S2Q8NGQ3 325 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ASB12Q8WXK4 309 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC3BQ96PB8 259 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR6C6A6NF89 314 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 FAM74A7A6NL05 159 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GLB1P16278 677 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 BCKDHBP21953 392 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LUMP51884 338 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 HBA1P69905 142 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 DSC2Q02487 901 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ACSM1Q08AH1 577 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PCGF3Q3KNV8 242 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SLC38A6Q8IZM9 456 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR9K2Q8NGE7 335 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR14L1PQ8NHC6 308 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR8D2Q9GZM6 311 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GSTO2Q9H4Y5 243 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 BANF2Q9H503 90 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 DUSP21Q9H596 190 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GJB5O95377 273 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ATP1B1P05026 303 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SFTPDP35247 375 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GATMP50440 423 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 RAB13P51153 203 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TNK1Q13470 666 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 FCN2Q15485 313 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TMPPEQ6ZT21 453 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TMPRSS12Q86WS5 348 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 RAB24Q969Q5 203 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM68Q96MH6 324 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SORT1Q99523 831 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF251Q9BRH9 671 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM43Q9BTV4 400 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CAPN10Q9HC96 672 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SIRT5Q9NXA8 310 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TAS2R5Q9NYW4 299 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SALL4Q9UJQ4 1053 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 FOXJ3Q9UPW0 622 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PIAS3Q9Y6X2 628 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 A0A087WZY1 265 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1B0GTW7 788 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM72A0PK05 275 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 DRGXA6NNA5 263 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 NPIPA2E9PIF3 369 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 NPIPA3F8WFD2 350 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 M0QZQ0 153 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 STBD1O95210 358 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 FBP1P09467 338 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SLURP2P0DP57 97 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 POU2F1P14859 743 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GPX2P18283 190 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CSKP41240 450 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RABGGTBP53611 331 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ATP1B3P54709 279 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 YPEL5P62699 121 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF91Q05481 1191 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 STK11Q15831 433 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6V1FQ16864 119 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TIGITQ495A1 244 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LILRB2Q8N423 598 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 FIBINQ8TAL6 211 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR1E3Q8WZA6 343 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 UCN3Q969E3 161 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 DMRTB1Q96MA1 342 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR2M4Q96R27 311 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SHARPINQ9H0F6 387 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SPHK2Q9NRA0 654 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SLC35D1Q9NTN3 355 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 VNN3Q9NY84 501 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 IL20RAQ9UHF4 553 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CFHP08603 1231 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PGA3P0DJD8 388 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 IRF2P14316 349 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MMP9P14780 707 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ITGB7P26010 798 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00596Q86U02 117 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.59□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms