RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 ARPC5O15511 151 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 CSO75390 466 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 CLDN9O95484 217 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 PNPP00491 289 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 MYL9P24844 172 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 TGM4P49221 684 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 POU4F2Q12837 409 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 TRAF3Q13114 568 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 VEZF1Q14119 521 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 GPR176Q14439 515 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 RBBP7Q16576 425 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 NRF1Q16656 503 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 XAF1Q6GPH4 301 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 ADCK2Q7Z695 626 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 AMER2Q8N7J2 671 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 ZNF383Q8NA42 475 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 RAB3CQ96E17 227 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 ZNF479Q96JC4 524 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 NT5DC2Q9H857 520 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 ACTR8Q9H981 624 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 FAM60AQ9NP50 221 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 TRBC2A0A5B9 178 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 K7EP13 123 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 ADAM10O14672 748 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 PRAMEF10O60809 474 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 CTSVO60911 334 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 RHBDL1O75783 438 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 CBX7O95931 251 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 SPP1P10451 314 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 TSPAN8P19075 237 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 CCNOP22674 350 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 GABRR1P24046 479 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 FMO3P31513 532 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 SH3BP2P78314 561 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 ATP6AP1Q15904 470 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 RNF44Q7L0R7 432 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 UBE2E3Q969T4 207 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 CMKLR1Q99788 373 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 SRRQ9GZT4 340 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 MFFQ9GZY8 342 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 CCSO14618 274 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 CHST10O43529 356 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 GLCEO94923 617 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 LDLRP01130 860 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 LIPFP07098 398 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 OR2T7P0C7T2 308 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 FOLR1P15328 257 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 CD22P20273 847 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 GABRA4P48169 554 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 KCNJ3P48549 501 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 CAMLGP49069 296 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 PRKXP51817 358 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 MAPK10P53779 464 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 CLDN6P56747 220 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 BST1Q10588 318 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 OR8G1Q15617 311 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 GK5Q6ZS86 529 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-201ENST00000351328 NUDT13Q86X67 352 aa6.46□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms