RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 FOXC1Q12948 553 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLC36A2Q495M3 483 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OR8G2PQ6IF36 304 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PODNL1Q6PEZ8 512 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 AAED1Q7RTV5 226 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 KCNJ15Q99712 375 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PRDM4Q9UKN5 801 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 RASD1Q9Y272 281 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ATG4BQ9Y4P1 393 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ABHD16AO95870 558 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 HEXAP06865 529 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OPCMLQ14982 345 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PLA1AQ53H76 456 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 YIF1BQ5BJH7 314 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 C18orf63Q68DL7 685 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TSSK4Q6SA08 328 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLC22A25Q6T423 547 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 RDH10Q8IZV5 341 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLC15A4Q8N697 577 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CDRT4Q8N9R6 151 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 STEAP2Q8NFT2 490 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ARL11Q969Q4 196 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 NICN1Q9BSH3 213 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 NRSN2Q9GZP1 204 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SYPL1Q16563 259 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 NPSR1Q6W5P4 371 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZADH2Q8N4Q0 377 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TRIB3Q96RU7 358 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TGM6O95932 706 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TK1P04183 234 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 WNT4P56705 351 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CLINT1Q14677 625 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 DEFB109BQ30KR1 87 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 FCRLAQ7L513 359 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SIMC1Q8NDZ2 872 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CD200R1Q8TD46 325 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PIGTQ969N2 578 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ACPTQ9BZG2 426 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PTTG3PQ9NZH4 202 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 MCRIP1C9JLW8 97 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 H0YAE9 185 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ADAM12O43184 909 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 DPM1O60762 260 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CHRNB1P11230 501 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLC5A2P31639 672 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CCR7P32248 378 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZBTB8AQ96BR9 441 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SORCS2Q96PQ0 1159 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 GMLQ99445 158 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OBP2AQ9NY56 170 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ABCC6O95255 1503 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SEMG1P04279 462 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OR8G3PP0DMU2 310 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 DEFB123Q8N688 67 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OR10X1Q8NGY0 326 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLC12A9Q9BXP2 914 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PELI2Q9HAT8 420 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CHEK1O14757 476 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 MSTNO14793 375 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 OR2J3O76001 311 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 OR8U8P0C7N1 319 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 ATP1B3P54709 279 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 VASH2Q86V25 355 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 SNAPC3Q92966 411 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 SCML1Q9UN30 329 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 V9GY05 133 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 ACOD1A6NK06 481 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 NME4O00746 187 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms