RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 WBP2NLQ6ICG8 309 aa13.39□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 CASP12Q6UXS9 341 aa13.39□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 COMTD1Q86VU5 262 aa13.39□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 CADM2Q8N3J6 435 aa13.39□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 OR9K2Q8NGE7 335 aa13.39□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 TMEM45BQ96B21 275 aa13.39□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 C3orf49Q96BT1 292 aa13.39□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 C7orf26Q96N11 449 aa13.39□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 RMND5AQ9H871 391 aa13.39□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 BCL2L10Q9HD36 194 aa13.39□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 A4GALTQ9NPC4 353 aa13.39□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 SLC17A5Q9NRA2 495 aa13.39□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 DCTN4Q9UJW0 460 aa13.39□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa13.39□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 AQP7P3A6NL99 342 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 A8MVM7 634 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 TMEM229AB2RXF0 380 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 RNF223E7ERA6 249 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 FRS3O43559 492 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 GPIP06744 558 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 CDH11P55287 796 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 EGR4Q05215 589 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 LGALS3BPQ08380 585 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 PAGE3Q5JUK9 113 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 C6orf10Q5SRN2 563 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 LRIF1Q5T3J3 769 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 AGBL2Q5U5Z8 902 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 OR7E24Q6IFN5 339 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 TMEM108Q6UXF1 575 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 SSX8Q7RTT4 187 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 BOD1Q96IK1 185 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 PTDSS2Q9BVG9 487 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 PARPBPQ9NWS1 579 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 ZNF232Q9UNY5 417 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa13.38□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 ABCA1O95477 2261 aa13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 A0A096LPI6 279 aa13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 FTCDNL1E5RQL4 147 aa13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 TGDSO95455 350 aa13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 PTAFRP25105 342 aa13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 VEZF1Q14119 521 aa13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 C1orf140Q5VVS0 124 aa13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 CREB3L2Q70SY1 520 aa13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 LINGO2Q7L985 606 aa13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 RADILQ96JH8 1075 aa13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 REG4Q9BYZ8 158 aa13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 ADAM21Q9UKJ8 722 aa13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 IFT52Q9Y366 437 aa13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 GMEB1Q9Y692 573 aa13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 CUBNO60494 3623 aa13.37□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 SONP18583 2426 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 M0R1B8 84 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 TPST1O60507 370 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 ERLIN1O75477 346 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 UQCRBP14927 111 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 MPGP29372 298 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 TTKP33981 857 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 ETFDHQ16134 617 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 ZSWIM7Q19AV6 140 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 TTMPQ5BVD1 217 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 ZNF311Q5JNZ3 666 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 AAED1Q7RTV5 226 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 EPHX4Q8IUS5 362 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 STK35Q8TDR2 534 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 DHRS9Q9BPW9 319 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 PRR14Q9BWN1 585 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 IKZF5Q9H5V7 419 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 PIF1Q9H611 641 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 TCF7L2Q9NQB0 619 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 ADPRHL2Q9NX46 363 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 VAPAQ9P0L0 249 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 UPB1Q9UBR1 384 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 SEC14L4Q9UDX3 406 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 MGAT4BQ9UQ53 548 aa13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 A0A096LNT2 108 aa13.35□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 FZD7O75084 574 aa13.35□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 SELENOPP49908 381 aa13.35□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 COPZ1P61923 177 aa13.35□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 FADDQ13158 208 aa13.35□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 TMEM225Q6GV28 225 aa13.35□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 SLC22A25Q6T423 547 aa13.35□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 GPAT4Q86UL3 456 aa13.35□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 KDM8Q8N371 416 aa13.35□□□□□ -0.27
CTSW-201ENST00000307886 C17orf78Q8N4C9 275 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms