RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRG3Q86Y34 549 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 NPEPL1Q8NDH3 523 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 OR52N1Q8NH53 320 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 MCFD2Q8NI22 146 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 UFD1Q92890 307 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 TIMP4Q99727 224 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 RERGLQ9H628 205 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 MPDZO75970 2070 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 PCNX3Q9H6A9 2034 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM72A0PK05 275 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 METTL15A6NJ78 407 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 PLD2O14939 933 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A12O75746 678 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 UQCRC1P31930 480 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 RPS25P62851 125 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 C17orf67Q0P5P2 114 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 DCAF12Q5T6F0 453 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 GRINAQ7Z429 371 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 NAXDQ8IW45 347 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 OR10G3Q8NGC4 313 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 ZNRF4Q8WWF5 429 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 BORCS5Q969J3 196 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 Q96M85 177 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 DDOQ99489 341 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 NPAS1Q99742 590 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 ALG8Q9BVK2 526 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 TMED7Q9Y3B3 224 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 HRH3Q9Y5N1 445 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa20.66■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 SUSD5O60279 629 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 IDUAP35475 653 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF404Q494X3 552 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 FAM122BQ7Z309 247 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 NUP54Q7Z3B4 507 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 OR2Y1Q8NGV0 311 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 RASL10BQ96S79 203 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 CDADC1Q9BWV3 514 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 HAO2Q9NYQ3 351 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 MED11Q9P086 117 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF229Q9UJW7 825 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 SSR3Q9UNL2 185 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 EXPH5Q8NEV8 1989 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 DAPL1A0PJW8 107 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 OR6C68A6NDL8 312 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 STK17BO94768 372 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 BGLAPP02818 100 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 COX6A1P12074 109 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 CTXN1P60606 82 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 KLBQ86Z14 1044 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 SMPDL3BQ92485 455 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 TTC9Q92623 222 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 TM9SF2Q99805 663 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 PTDSS2Q9BVG9 487 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 ASPNQ9BXN1 380 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 FKRPQ9H9S5 495 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 AKIP1Q9NQ31 210 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 ASB6Q9NWX5 421 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 KLRF1Q9NZS2 232 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
VSTM4-201ENST00000298454 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa20.64■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 CD14P08571 375 aa20.64■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 ISXQ2M1V0 245 aa20.64■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 SLC22A8Q8TCC7 542 aa20.64■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 RNF138Q8WVD3 245 aa20.64■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 IMMP1LQ96LU5 166 aa20.64■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 DACH2Q96NX9 599 aa20.64■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF700Q9H0M5 742 aa20.64■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 TTC28Q96AY4 2481 aa20.64■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 ANKUB1A6NFN9 424 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 IDH3BO43837 385 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 CBFA2T3O75081 653 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 HIST1H2ABP04908 130 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 TMED10P49755 219 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 LINC00299Q6ZSB3 139 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 HIST1H2ACQ93077 130 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A36Q96CQ1 311 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 CLDN25C9JDP6 229 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 NPIPB7O75200 414 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 PTGDSP41222 190 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 GALEQ14376 348 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 BTLAQ7Z6A9 289 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 OR11A1Q9GZK7 315 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 PISDQ9UG56 409 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms