RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 ARPC3O15145 178 aa17.58■□□□□ 0.4
USP21-201ENST00000289865 OGG1O15527 345 aa17.58■□□□□ 0.4
USP21-201ENST00000289865 IDH3BO43837 385 aa17.58■□□□□ 0.4
USP21-201ENST00000289865 UTS2O95399 124 aa17.58■□□□□ 0.4
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USP21-201ENST00000289865 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa17.55■□□□□ 0.4
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USP21-201ENST00000289865 ZNF264O43296 627 aa17.55■□□□□ 0.4
USP21-201ENST00000289865 HOXD12P35452 270 aa17.55■□□□□ 0.4
USP21-201ENST00000289865 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
USP21-201ENST00000289865 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
USP21-201ENST00000289865 JAZF1Q86VZ6 243 aa17.55■□□□□ 0.4
USP21-201ENST00000289865 ADOQ96SZ5 270 aa17.55■□□□□ 0.4
USP21-201ENST00000289865 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa17.55■□□□□ 0.4
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