RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 MAPK9P45984 424 aa20.21■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 SCARB2Q14108 478 aa20.21■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 PARM1Q6UWI2 310 aa20.21■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 FGF14Q92915 247 aa20.21■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 RAB3CQ96E17 227 aa20.21■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.21■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 AUNIPQ9H7T9 357 aa20.21■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 CD207Q9UJ71 328 aa20.21■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 COL4A3Q01955 1670 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 OR6C76A6NM76 312 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 FAAHO00519 579 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 YY2O15391 372 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 TSPAN6O43657 245 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 ACTL6AO96019 429 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 CERS1P27544 350 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 SHC1P29353 583 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 DDTP30046 118 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 SSPNQ14714 243 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 SMARCD3Q6STE5 483 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 ZNF813Q6ZN06 617 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 GLYATL1Q969I3 302 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 CMTM3Q96MX0 182 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 TEAD3Q99594 435 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 SLC32A1Q9H598 525 aa20.2■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 K7ESM1 405 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 PGRMC2O15173 223 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 RNF13O43567 381 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 OR10H3O60404 316 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 SERPIND1P05546 499 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 C8GP07360 202 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 MPC1LP0DKB6 136 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 LAMP2P13473 410 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 ZNF234Q14588 700 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 OR52W1Q6IF63 320 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 OR6X1Q8NH79 312 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 APIPQ96GX9 242 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 MESP1Q9BRJ9 268 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 CLEC4AQ9UMR7 237 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 TRBC2A0A5B9 178 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 FFAR1O14842 300 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 PRAMEF4O60810 478 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 ASMTP46597 345 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 LUMP51884 338 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 OR10A3P58181 314 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 DNLZQ5SXM8 178 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 DCST1Q5T197 706 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 RAB12Q6IQ22 244 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 NOXRED1Q6NXP6 359 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 VITQ6UXI7 678 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 KCNRGQ8N5I3 272 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 ZNF511Q8NB15 262 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 APOLD1Q96LR9 279 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 METTL9Q9H1A3 318 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 UQCC1Q9NVA1 299 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 LAMP5Q9UJQ1 280 aa20.19■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 CLDN9O95484 217 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 CD2P06729 351 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 TYRP1P17643 537 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 AMD1P17707 334 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 AGTR1P30556 359 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 SLC6A12P48065 614 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 SORDQ00796 357 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 GINS1Q14691 196 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 OLFML2AQ68BL7 652 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 PGBD2Q6P3X8 592 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 SYT12Q8IV01 421 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 ARL11Q969Q4 196 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 MISP3Q96FF7 219 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 ACKR4Q9NPB9 350 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 DUSP22Q9NRW4 184 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 FGF16O43320 207 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 SLCO2B1O94956 709 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 PRNPP04156 253 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 GAB1Q13480 694 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 C2orf68Q2NKX9 166 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 AKIRIN2Q53H80 203 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 PRSS45Q7RTY3 260 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 TMEM200AQ86VY9 491 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 DTD2Q96FN9 168 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 ZNF559Q9BR84 538 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 SLC22A14Q9Y267 594 aa20.18■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms