RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261609.11

HERC2-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC2, Length 15,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-201ENST00000261609 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 UCN3Q969E3 161 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 SGK3Q96BR1 496 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 OTOFQ9HC10 1997 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 AKAP12Q02952 1782 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 B4DGG1 531 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CSO75390 466 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 PNMTP11086 282 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ISL1P61371 349 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ZNF611Q8N823 705 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 OR8U1Q8NH10 309 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ACPTQ9BZG2 426 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 LDAHQ9H6V9 325 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 A0A087X0M5 115 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 A0A0U1RQF3 1178 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 A0A1B0GX30 115 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 NSA2O95478 260 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 RNF39Q9H2S5 420 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 TLR9Q9NR96 1032 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 TP53I11O14683 189 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ITGB2P05107 769 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 IMPA1P29218 277 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CLDN12P56749 244 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 AQP6Q13520 282 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 SAXO2Q658L1 398 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 BRICD5Q6PL45 260 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CBLL1Q75N03 491 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 IGSF8Q969P0 613 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 FBXW5Q969U6 566 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 LRFN5Q96NI6 719 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 56.6
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HERC2-201ENST00000261609 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 SCO2O43819 266 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 TGM1P22735 817 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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HERC2-201ENST00000261609 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 M0QYG6 137 aa6.69□□□□□ -1.34
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HERC2-201ENST00000261609 TMEM18Q96B42 140 aa6.69□□□□□ -1.34
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HERC2-201ENST00000261609 CLLU1Q5K131 121 aa6.69□□□□□ -1.34
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HERC2-201ENST00000261609 SQSTM1Q13501 440 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 SHISA4Q96DD7 197 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 DPH1Q9BZG8 443 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CHRDQ9H2X0 955 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CLMPQ9H6B4 373 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 MED17Q9NVC6 651 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 J3KTA2 159 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 NDUFB2O95178 105 aa6.69□□□□□ -1.34
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