RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 KIAA1024LP59773 190 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 GAS6Q14393 721 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM255AQ5JRV8 349 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 CREB3L2Q70SY1 520 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF767PQ75MW2 155 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 JAZF1Q86VZ6 243 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 CDRT4Q8N9R6 151 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 MOSPD2Q8NHP6 518 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 NT5DC2Q9H857 520 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SIGLEC5O15389 551 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 GPR75O95800 540 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00271P0C7V0 271 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SIGLEC14Q08ET2 396 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 GRK1Q15835 563 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PLA1AQ53H76 456 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 TEX261Q6UWH6 196 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 AVL9Q8NBF6 648 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 FGF11Q92914 225 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SOHLH2Q9NX45 425 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ERVK-19Q9WJR5 959 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 U3KQ87 197 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ANXA2P2A6NMY6 339 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 LGALS8O00214 317 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PDGFAP04085 211 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SRMP19623 302 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 LSSP48449 732 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ADPRHP54922 357 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PER3P56645 1201 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 DUSP8Q13202 625 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ESCO2Q56NI9 601 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 OR5M10Q6IEU7 315 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 NHLRC1Q6VVB1 395 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFAF7Q7L592 441 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PAQR7Q86WK9 346 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 IL17RCQ8NAC3 791 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 C10orf90Q96M02 699 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SERINC2Q96SA4 455 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 LRRK1Q38SD2 2015 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 H0YC42 278 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 NRG3P56975 720 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ELOA3BQ3SY89 546 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SFRP5Q5T4F7 317 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ZBTB37Q5TC79 503 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 RNLSQ5VYX0 342 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ELOA3Q8NG57 546 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 OR2A5Q96R48 311 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 KCNJ15Q99712 375 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 TIMP4Q99727 224 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 OR8D2Q9GZM6 311 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 OR6C68A6NDL8 312 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 L7N2F9 121 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 LINC01565O15544 149 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 KDM4BO94953 1096 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 CTXN1P60606 82 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SLC36A2Q495M3 483 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 DMRTC1Q5HYR2 192 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 KDM8Q8N371 416 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 MS4A15Q8N5U1 240 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 RLN3Q8WXF3 142 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PPP1R14AQ96A00 147 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 NXPE2Q96DL1 559 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SGTBQ96EQ0 304 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 TIMM29Q9BSF4 260 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 C20orf85Q9H1P6 137 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 NOX3Q9HBY0 568 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ISYNA1Q9NPH2 558 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PRDM9Q9NQV7 894 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 MED17Q9NVC6 651 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 FAM25EA8MYX2 175 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFB2O95178 105 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 AGR2O95994 175 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 THBS2P35442 1172 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 RPS15P62841 145 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PITPNAQ00169 270 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM196Q5HYL7 178 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 OR2L13Q8N349 312 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 FCAMRQ8WWV6 532 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 RSC1A1Q92681 617 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 FAM60AQ9NP50 221 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 NCDNQ9UBB6 729 aa12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms