RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 FAM156AQ8NDB6 213 aa19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 MFSD8Q8NHS3 518 aa19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 PROX1Q92786 737 aa19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 CDRT15Q96T59 188 aa19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ADA2Q9NZK5 511 aa19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 EGFL7Q9UHF1 273 aa19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 HSD17B1P14061 328 aa19.78■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 CD79BP40259 229 aa19.78■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 RPS5P46782 204 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 SORDQ00796 357 aa19.78■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 SLC17A1Q14916 467 aa19.78■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 LINC01560Q8TB33 94 aa19.78■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 LRRC46Q96FV0 321 aa19.78■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 PRSS27Q9BQR3 290 aa19.78■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 CRIM1Q9NZV1 1036 aa19.78■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa19.78■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ABCA12Q86UK0 2595 aa19.78■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 AQP7P3A6NL99 342 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 B2RBV5 119 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 GSTA4O15217 222 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 CHP2O43745 196 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 FUT4P22083 530 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 CCKARP32238 428 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 GLYATQ6IB77 296 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 DEFB107AQ8IZN7 70 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ZIC4Q8N9L1 334 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 PIGXQ8TBF5 258 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 TPD52L3Q96J77 140 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 TMEM43Q9BTV4 400 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ZNF426Q9BUY5 554 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ADPRHL2Q9NX46 363 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ELOVL5Q9NYP7 299 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 SEC14L4Q9UDX3 406 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 SNX13Q9Y5W8 968 aa19.77■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC13A5PLN9 417 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 AHSA1O95433 338 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 SERPINA1P01009 418 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 PTNP21246 168 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 OR3A2P47893 321 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 RINLQ6ZS11 566 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 C22orf34Q6ZV56 151 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 GDF7Q7Z4P5 450 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 KIF18BQ86Y91 864 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 TAPBPLQ9BX59 468 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 KCNN3Q9UGI6 736 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 SLC7A7Q9UM01 511 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 TACC2O95359 2948 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 BGLAPP02818 100 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 POU2F1P14859 743 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 UGT2B10P36537 528 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DL3P43628 341 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 MNAT1P51948 309 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 FAM69AQ5T7M9 428 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 C5orf46Q6UWT4 87 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 C16orf89Q6UX73 402 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 STAC2Q6ZMT1 411 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 GALNT5Q7Z7M9 940 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 GABRG1Q8N1C3 465 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 OR6S1Q8NH40 331 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 RNF217Q8TC41 542 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A36Q96CQ1 311 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 C14orf79Q96F83 325 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 SLC41A3Q96GZ6 507 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 SELENONQ9NZV5 590 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 PRSS50Q9UI38 385 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 A4GNTQ9UNA3 340 aa19.76■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 NOTCH2Q04721 2471 aa19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 PRR14LQ5THK1 2151 aa19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 LRRN3E7EW58 273 aa19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 OR2T1O43869 369 aa19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 CALB2P22676 271 aa19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 PEX19P40855 299 aa19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 DEF8Q6ZN54 512 aa19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 BEND4Q6ZU67 534 aa19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 NKAIN4Q8IVV8 208 aa19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 GORASP2Q9H8Y8 452 aa19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 RIMS3Q9UJD0 308 aa19.75■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 FAM221AA4D161 298 aa19.74■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 TUBAL3A6NHL2 446 aa19.74■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 FFAR1O14842 300 aa19.74■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 OR5F1O95221 314 aa19.74■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 ZNF682O95780 498 aa19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms