RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637500.1

TCF4-287, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-287	ENST00000637500	GOPC	Q9HD26	462 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF358	Q9NW07	568 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TCF4-287	ENST00000637500	ZFAT	Q9P243	1243 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TCF4-287	ENST00000637500	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TCF4-287	ENST00000637500	UVSSA	Q2YD98	709 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	3.21	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	MYRFL	Q96LU7	910 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	PAPLN	O95428	1278 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	3.2	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	GPLD1	P80108	840 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	TNS4	Q8IZW8	715 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	BANK1	Q8NDB2	785 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	WISP1	O95388	367 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	LILRA6	Q6PI73	481 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	FBXL18	Q96ME1	805 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	CEP41	Q9BYV8	373 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	PIM2	Q9P1W9	311 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	WDR64	B1ANS9	1081 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	IRF5	Q13568	498 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	COL26A1	Q96A83	441 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	IFT43	Q96FT9	208 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	PNMA5	Q96PV4	448 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500		B8ZZF3	427 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	FOSL1	P15407	271 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	NRL	P54845	237 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	IER5	Q5VY09	327 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	SNRK	Q9NRH2	765 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	JAG2	Q9Y219	1238 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	BEND4	Q6ZU67	534 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	PLD4	Q96BZ4	506 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	BCS1L	Q9Y276	419 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TCF4-287	ENST00000637500	C21orf2	O43822	256 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	F13B	P05160	661 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	INPP5B	P32019	993 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	GTF2I	P78347	998 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	C1QL4	Q86Z23	238 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	BMP3	P12645	472 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	SIK1	P57059	783 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	MESP2	Q0VG99	397 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	HIF1A	Q16665	826 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	ACAD11	Q709F0	780 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	SHISA5	Q8N114	240 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500		J3QW42	95 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	PIK3CD	O00329	1044 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	SASH3	O75995	380 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TCF4-287	ENST00000637500	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91

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