RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636351.1

CLN3-247, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,292 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-247ENST00000636351 VAMP4O75379 141 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 PARP10Q53GL7 1025 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 CNTROBQ8N137 903 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 VEGFBP49765 207 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 NLRP3Q96P20 1036 aa22.79■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 LTBP1Q14766 1721 aa22.78■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 FOXN1O15353 648 aa22.77■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 SLC4A2P04920 1241 aa22.76■■□□□ 1.23
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CLN3-247ENST00000636351 NIM1KQ8IY84 436 aa22.76■■□□□ 1.23
CLN3-247ENST00000636351 PPIP5K2O43314 1243 aa22.75■■□□□ 1.23
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CLN3-247ENST00000636351 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.75■■□□□ 1.23
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CLN3-247ENST00000636351 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CLN3-247ENST00000636351 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN3-247ENST00000636351 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CLN3-247ENST00000636351 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN3-247ENST00000636351 ABCC4O15439 1325 aa22.75■■□□□ 1.23
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CLN3-247ENST00000636351 AOC3Q16853 763 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-247ENST00000636351 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-247ENST00000636351 AIDAQ96BJ3 306 aa22.74■■□□□ 1.23
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CLN3-247ENST00000636351 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.72■■□□□ 1.23
CLN3-247ENST00000636351 NLRP10Q86W26 655 aa22.72■■□□□ 1.23
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CLN3-247ENST00000636351 G2E3Q7L622 706 aa22.71■■□□□ 1.23
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CLN3-247ENST00000636351 LAMB2P55268 1798 aa22.67■■□□□ 1.22
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CLN3-247ENST00000636351 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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CLN3-247ENST00000636351 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.62■■□□□ 1.21
CLN3-247ENST00000636351 CAPNS2Q96L46 248 aa22.62■■□□□ 1.21
CLN3-247ENST00000636351 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN3-247ENST00000636351 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN3-247ENST00000636351 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN3-247ENST00000636351 F6X3S4 739 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN3-247ENST00000636351 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN3-247ENST00000636351 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.59■■□□□ 1.21
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