RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627578.2

FHL1-223, Transcript of four and a half LIM domains 1, human

TSL 4

Gene FHL1, Length 580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FHL1-223	ENST00000627578	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	EPHX2	P34913	555 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	MYD88	Q99836	296 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	VPS33B	Q9H267	617 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	MPND	Q8N594	471 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	SCNN1D	P51172	638 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	TMC4	Q7Z404	712 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	IL16	Q14005	1332 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	CREBZF	Q9NS37	354 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	EPS15	P42566	896 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	CXCL9	Q07325	125 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	KSR2	Q6VAB6	950 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	GPSM2	P81274	684 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	G2E3	Q7L622	706 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	YDJC	A8MPS7	323 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	PDE8A	O60658	829 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	RAD17	O75943	681 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	SLC4A2	P04920	1241 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	POLL	Q9UGP5	575 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	PCNT	O95613	3336 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	WASHC4	Q2M389	1173 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	CNTNAP1	P78357	1384 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	C6orf229	H3BNL8	230 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	RIMBP2	O15034	1052 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	VAMP4	O75379	141 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	FLII	Q13045	1269 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	TNIP1	Q15025	636 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
FHL1-223	ENST00000627578	MYH3	P11055	1940 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FHL1-223	ENST00000627578	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
FHL1-223	ENST00000627578	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
FHL1-223	ENST00000627578	CTSW	P56202	376 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FHL1-223	ENST00000627578	EYA3	Q99504	573 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FHL1-223	ENST00000627578	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FHL1-223	ENST00000627578	SPEF2	Q9C093	1822 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FHL1-223	ENST00000627578	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.19	□□□□□ -0.3
FHL1-223	ENST00000627578	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
FHL1-223	ENST00000627578	DOK7	Q18PE1	504 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FHL1-223	ENST00000627578	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FHL1-223	ENST00000627578	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FHL1-223	ENST00000627578	CACNA1F	O60840	1977 aa		13.19	□□□□□ -0.3

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