RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623333.1

AP000997.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AP000997.3, Length 2,250 nt, Biotype TEC.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000997.3-201ENST00000623333 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.18■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 AOX1Q06278 1338 aa22.18■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.17■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 UQCRHP07919 91 aa22.17■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.17■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.17■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 COPRSQ9NQ92 184 aa22.17■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.17■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 ITPK1Q13572 414 aa22.16■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 AACSQ86V21 672 aa22.16■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 PALLDQ8WX93 1383 aa22.16■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 DYNC1I1O14576 645 aa22.15■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.15■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 AK9Q5TCS8 1911 aa22.15■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 ST18O60284 1047 aa22.14■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 GPTP24298 496 aa22.14■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 FAM182BQ5T319 152 aa22.14■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.14■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.14■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.14■■□□□ 1.14
AP000997.3-201ENST00000623333 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 FAM89AQ96GI7 184 aa22.14■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.14■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.12■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 AFF2P51816 1311 aa22.12■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.12■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.11■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.11■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 CHMLP26374 656 aa22.11■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.11■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 SYNE4Q8N205 404 aa22.11■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 ERC2O15083 957 aa22.1■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 TFCP2Q12800 502 aa22.1■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 NLRP10Q86W26 655 aa22.1■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 KCNQ4P56696 695 aa22.1■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 SYCE3A1L190 88 aa22.09■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.09■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.09■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 MBD3O95983 291 aa22.09■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 GPATCH3Q96I76 525 aa22.09■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.08■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
AP000997.3-201ENST00000623333 REC8O95072 547 aa22.08■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 CNTROBQ8N137 903 aa22.06■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 NUP98P52948 1817 aa22.06■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 TNNI3KQ59H18 835 aa22.05■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.05■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.05■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.05■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.05■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 LRRC24Q50LG9 513 aa22.04■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.04■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.04■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.04■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.04■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 IL25Q9H293 177 aa22.04■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 EP400Q96L91 3159 aa22.04■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.03■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 RREB1Q92766 1687 aa22.03■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 BRD1O95696 1058 aa22.03■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 BTAF1O14981 1849 aa22.02■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 CAMTA2O94983 1202 aa22.02■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 CSF1RP07333 972 aa22.02■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.02■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.02■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 ATRNO75882 1429 aa22.02■■□□□ 1.12
AP000997.3-201ENST00000623333 EYA2O00167 538 aa22.01■■□□□ 1.11
AP000997.3-201ENST00000623333 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms