RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622939.3

CU633967.1-209, humanhuman

TSL 3

Gene CU633967.1, Length 589 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-209ENST00000622939 CCDC27Q2M243 656 aa9.55□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 KRT24Q2M2I5 525 aa9.55□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.55□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 CIAPIN1Q6FI81 312 aa9.55□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 CCDC191Q8NCU4 936 aa9.55□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 DDX58O95786 925 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 VEGFBP49765 207 aa9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 RPS8P62241 208 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 GOLGA2Q08379 1002 aa9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 AOC3Q16853 763 aa9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 WASHC4Q2M389 1173 aa9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 TNS4Q8IZW8 715 aa9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 FAM89AQ96GI7 184 aa9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 HHIPL1Q96JK4 782 aa9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 WBP1LQ9NX94 342 aa9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.54□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 RPS12P25398 132 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 ECE1P42892 770 aa9.53□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 AIDAQ96BJ3 306 aa9.53□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 EYA3Q99504 573 aa9.53□□□□□ -0.88
CU633967.1-209ENST00000622939 PCNTO95613 3336 aa9.52□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.52□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 H7C1D1 291 aa9.52□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 MAP2K2P36507 400 aa9.52□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.52□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa9.52□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 IL16Q14005 1332 aa9.52□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 SCN4AP35499 1836 aa9.52□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 LAMB4A4D0S4 1761 aa9.51□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 PDE8AO60658 829 aa9.51□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 MMP14P50281 582 aa9.51□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.51□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 CST9Q5W186 159 aa9.51□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 KSR2Q6VAB6 950 aa9.51□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.51□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.51□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.51□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 C6orf229H3BNL8 230 aa9.5□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 RAD17O75943 681 aa9.5□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 VIL1P09327 827 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.5□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 POLLQ9UGP5 575 aa9.5□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.5□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 YDJCA8MPS7 323 aa9.49□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 FOXN1O15353 648 aa9.49□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 CA12O43570 354 aa9.49□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 GPSM2P81274 684 aa9.49□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 NEXNQ0ZGT2 675 aa9.49□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 PODNQ7Z5L7 613 aa9.49□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.49□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 WWC1Q8IX03 1113 aa9.49□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 MYD88Q99836 296 aa9.49□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.49□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 STK31Q9BXU1 1019 aa9.49□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 PI4KAP2A4QPH2 592 aa9.48□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 ATP2B4P23634 1241 aa9.48□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 WDR63Q8IWG1 891 aa9.48□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa9.48□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 AGBL3Q8NEM8 1001 aa9.48□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 CAPNS2Q96L46 248 aa9.48□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 GGA1Q9UJY5 639 aa9.48□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 COL4A5P29400 1685 aa9.48□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 NUP98P52948 1817 aa9.47□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 H7C1W4 665 aa9.47□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 TRAF5O00463 557 aa9.47□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 PSMD14O00487 310 aa9.47□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 CELF2O95319 508 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.47□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 MICALL2Q8IY33 904 aa9.47□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.47□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa9.47□□□□□ -0.89
CU633967.1-209ENST00000622939 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms