RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607707.1

SNORD11B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 11B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD11B, Length 90 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD11B-201ENST00000607707 LRRC4BQ9NT99 713 aa4.06□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4.05□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 UBAP1LF5GYI3 381 aa4.05□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 ADH7P40394 386 aa4.05□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 NLRP13Q86W25 1043 aa4.05□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 GJD3Q8N144 294 aa4.05□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 GALNT6Q8NCL4 622 aa4.05□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 EDARADDQ8WWZ3 215 aa4.05□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 PNMA5Q96PV4 448 aa4.05□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 TMEM63CQ9P1W3 806 aa4.05□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 ZBTB42B2RXF5 422 aa4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 MMP20O60882 483 aa4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 MAP3K6O95382 1288 aa4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 IGHA2P01877 340 aa4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 GPLD1P80108 840 aa4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 MAP3K10Q02779 954 aa4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 NEUROD1Q13562 356 aa4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 ELOA3BQ3SY89 546 aa4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 KCTD17Q8N5Z5 321 aa4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 ELOA3Q8NG57 546 aa4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 NAGPAQ9UK23 515 aa4.04□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 SOX18P35713 384 aa4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 DGKGP49619 791 aa4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 AAMPQ13685 434 aa4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 XKR5Q6UX68 686 aa4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 CHSY3Q70JA7 882 aa4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 TRPM4Q8TD43 1214 aa4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 FAM129BQ96TA1 746 aa4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 CHRDQ9H2X0 955 aa4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 STK17AQ9UEE5 414 aa4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 SLC6A14Q9UN76 642 aa4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 STARD13Q9Y3M8 1113 aa4.03□□□□□ -1.76
SNORD11B-201ENST00000607707 GPR182O15218 404 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 NDUFB5O43674 189 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 ALBP02768 609 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 PCSK2P16519 638 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 USP5P45974 858 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 NRLP54845 237 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 C8orf34Q49A92 452 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 ZNF438Q7Z4V0 828 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 OR13H1Q8NG92 308 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 BTBD6Q96KE9 485 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 RBCK1Q9BYM8 510 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 IGFLR1Q9H665 355 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 ELP3Q9H9T3 547 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 CNTN3Q9P232 1028 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 BRPF3Q9ULD4 1205 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 ADAMTS8Q9UP79 889 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 TNFRSF21O75509 655 aa4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 KIF4AO95239 1232 aa4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 PSAPP07602 524 aa4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 PLAURQ03405 335 aa4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 EHHADHQ08426 723 aa4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 KANK3Q6NY19 840 aa4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 C20orf204Q6ZNR8 217 aa4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 C8orf86Q6ZUL3 223 aa4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 C1orf127Q8N9H9 656 aa4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 NEDD1Q8NHV4 660 aa4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 SNX29Q8TEQ0 813 aa4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 LPIN3Q9BQK8 851 aa4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 ENAMQ9NRM1 1142 aa4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 KANSL3Q9P2N6 904 aa4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 DCTN4Q9UJW0 460 aa4.01□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 FAM181BA6NEQ2 426 aa4□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 M0R082 166 aa4□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 CPB1P15086 417 aa4□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 ALAS2P22557 587 aa4□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 AMPD1P23109 780 aa4□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 MAPK1P28482 360 aa4□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 GRIK5Q16478 980 aa4□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa4□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 LINC00114Q6XXX2 140 aa4□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 HFE2Q6ZVN8 426 aa4□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 TMC7Q7Z402 723 aa4□□□□□ -1.77
SNORD11B-201ENST00000607707 FAM35AQ86V20 835 aa4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms