RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.22■■□□□ 1.15
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ZNF548-204ENST00000594693 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.21■■□□□ 1.15
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ZNF548-204ENST00000594693 GNAI3P08754 354 aa22.2■■□□□ 1.14
ZNF548-204ENST00000594693 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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ZNF548-204ENST00000594693 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.2■■□□□ 1.14
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ZNF548-204ENST00000594693 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.19■■□□□ 1.14
ZNF548-204ENST00000594693 BCS1LQ9Y276 419 aa22.19■■□□□ 1.14
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ZNF548-204ENST00000594693 BBOX1O75936 387 aa22.18■■□□□ 1.14
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ZNF548-204ENST00000594693 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.18■■□□□ 1.14
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ZNF548-204ENST00000594693 GREM2Q9H772 168 aa22.18■■□□□ 1.14
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ZNF548-204ENST00000594693 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.17■■□□□ 1.14
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ZNF548-204ENST00000594693 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.15■■□□□ 1.14
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ZNF548-204ENST00000594693 GNAI2P04899 355 aa22.14■■□□□ 1.13
ZNF548-204ENST00000594693 FAM161AQ3B820 660 aa22.14■■□□□ 1.13
ZNF548-204ENST00000594693 C21orf2O43822 256 aa22.13■■□□□ 1.13
ZNF548-204ENST00000594693 ITGA6P23229 1130 aa22.13■■□□□ 1.13
ZNF548-204ENST00000594693 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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ZNF548-204ENST00000594693 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.12■■□□□ 1.13
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ZNF548-204ENST00000594693 MYH3P11055 1940 aa22.12■■□□□ 1.13
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ZNF548-204ENST00000594693 COL4A1P02462 1669 aa22.07■■□□□ 1.12
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ZNF548-204ENST00000594693 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ZNF548-204ENST00000594693 CEP85Q6P2H3 762 aa22.02■■□□□ 1.12
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ZNF548-204ENST00000594693 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.02■■□□□ 1.12
ZNF548-204ENST00000594693 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ZNF548-204ENST00000594693 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.02■■□□□ 1.12
ZNF548-204ENST00000594693 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.02■■□□□ 1.12
ZNF548-204ENST00000594693 GPSM2P81274 684 aa22.01■■□□□ 1.11
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