RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.42■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 GLTPD2A6NH11 291 aa25.42■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.42■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 SP8Q8IXZ3 490 aa25.4■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 PDE8AO60658 829 aa25.39■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 LINS1Q8NG48 757 aa25.39■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 H7C1W4 665 aa25.38■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 GCKRQ14397 625 aa25.38■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 COL4A5P29400 1685 aa25.38■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 WDR90Q96KV7 1748 aa25.37■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 F6X3S4 739 aa25.37■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 TMC4Q7Z404 712 aa25.37■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 MYH3P11055 1940 aa25.37■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 RRAGCQ9HB90 399 aa25.36■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 CASP7P55210 303 aa25.35■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 BEND3Q5T5X7 828 aa25.35■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.35■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.35■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.34■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.34■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.34■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 FZD9O00144 591 aa25.33■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 CTSWP56202 376 aa25.33■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 LTBP1Q14766 1721 aa25.33■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.33■■□□□ 1.65
EFTUD2-217ENST00000590124 POTECB2RU33 542 aa25.32■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 TOMM70O94826 608 aa25.32■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 MPNDQ8N594 471 aa25.32■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.32■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 VPS33BQ9H267 617 aa25.32■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.32■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.31■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.31■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.3■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 RTL9Q8NET4 1388 aa25.3■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.29■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 JDP2Q8WYK2 163 aa25.29■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 PTPRCP08575 1304 aa25.28■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 PPIP5K2O43314 1243 aa25.27■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 ALDH1L1O75891 902 aa25.27■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 AOC3Q16853 763 aa25.27■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.27■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 GREM2Q9H772 168 aa25.27■■□□□ 1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 GPSM2P81274 684 aa25.26■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.26■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 SCN4AP35499 1836 aa25.26■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 CSF1RP07333 972 aa25.25■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.25■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.25■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 SPEF2Q9C093 1822 aa25.24■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.24■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 NIM1KQ8IY84 436 aa25.24■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.24■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 GRM8O00222 908 aa25.23■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 GPC2Q8N158 579 aa25.23■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.23■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 POLLQ9UGP5 575 aa25.23■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 FOXO4P98177 505 aa25.22■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.21■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.21■■□□□ 1.63
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM161AQ3B820 660 aa25.2■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 UTYO14607 1347 aa25.19■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.19■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 ITGA6P23229 1130 aa25.19■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 FSTL1Q12841 308 aa25.19■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 WASHC4Q2M389 1173 aa25.19■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 C6orf229H3BNL8 230 aa25.18■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 HSPA6P17066 643 aa25.18■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.18■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 CXCL9Q07325 125 aa25.17■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.17■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 EYA3Q99504 573 aa25.17■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.17■■□□□ 1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms