RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.67■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 CCDC184Q52MB2 194 aa23.67■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 GOLGA2Q08379 1002 aa23.66■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.66■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.66■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 ZNF428Q96B54 188 aa23.66■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.66■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 CCDC27Q2M243 656 aa23.65■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.65■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 CNTROBQ8N137 903 aa23.65■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 CNTNAP1P78357 1384 aa23.65■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.64■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 EPS15P42566 896 aa23.64■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.64■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 CXCL9Q07325 125 aa23.63■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 PCNTO95613 3336 aa23.62■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.62■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 COL4A1P02462 1669 aa23.62■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.61■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 TSPYL6Q8N831 410 aa23.6■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.6■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 MYD88Q99836 296 aa23.6■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.59■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.59■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 WWC1Q8IX03 1113 aa23.59■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CTIF-206ENST00000588345 TNIP1Q15025 636 aa23.57■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 IL16Q14005 1332 aa23.57■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 YDJCA8MPS7 323 aa23.56■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 RASSF10A6NK89 507 aa23.55■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 RAD17O75943 681 aa23.55■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 GPSM2P81274 684 aa23.55■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 WASHC4Q2M389 1173 aa23.55■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.55■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 PDE8AO60658 829 aa23.54■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 VEGFBP49765 207 aa23.54■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 KSR2Q6VAB6 950 aa23.54■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 POLLQ9UGP5 575 aa23.54■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.54■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 MRS2Q9HD23 443 aa23.53■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.53■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.53■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.53■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.52■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.52■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 EYA3Q99504 573 aa23.52■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.52■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 STK31Q9BXU1 1019 aa23.52■■□□□ 1.36
CTIF-206ENST00000588345 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.51■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 C6orf229H3BNL8 230 aa23.51■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 ANP32CO43423 234 aa23.51■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 IGKV5-2P06315 115 aa23.51■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.51■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.51■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 DPF2Q92785 391 aa23.49■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.49■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 MYH3P11055 1940 aa23.49■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 CACNA1FO60840 1977 aa23.49■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 TRAF5O00463 557 aa23.48■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 RIMBP2O15034 1052 aa23.48■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 CST9Q5W186 159 aa23.48■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 PSMD14O00487 310 aa23.47■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 ECE2O60344 883 aa23.47■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.47■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 G2E3Q7L622 706 aa23.47■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 WDR63Q8IWG1 891 aa23.47■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.47■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 SHTN1A0MZ66 631 aa23.46■■□□□ 1.35
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