RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577409.1

CNDP2-204, Transcript of carnosine dipeptidase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CNDP2, Length 422 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP2-204ENST00000577409 PTPRCP08575 1304 aa26.59■■□□□ 1.85
CNDP2-204ENST00000577409 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.59■■□□□ 1.85
CNDP2-204ENST00000577409 LAMB2P55268 1798 aa26.58■■□□□ 1.85
CNDP2-204ENST00000577409 CACNA1SQ13698 1873 aa26.58■■□□□ 1.85
CNDP2-204ENST00000577409 BBOX1O75936 387 aa26.58■■□□□ 1.85
CNDP2-204ENST00000577409 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.58■■□□□ 1.85
CNDP2-204ENST00000577409 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.57■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 CTSWP56202 376 aa26.56■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.55■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.55■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.55■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 ALDH1L1O75891 902 aa26.54■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.54■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 SP8Q8IXZ3 490 aa26.54■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.54■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.54■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 GRM8O00222 908 aa26.52■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 BCAR3O75815 825 aa26.52■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 SBF1O95248 1867 aa26.52■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 PSMD1Q99460 953 aa26.52■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 GREM2Q9H772 168 aa26.52■■□□□ 1.84
CNDP2-204ENST00000577409 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 TAF1P21675 1872 aa26.51■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.5■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 CSF1RP07333 972 aa26.49■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 FOXO4P98177 505 aa26.49■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 FAM161AQ3B820 660 aa26.47■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.47■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 TMC4Q7Z404 712 aa26.47■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 KAZALD1Q96I82 304 aa26.47■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 RTL9Q8NET4 1388 aa26.46■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 MPNDQ8N594 471 aa26.46■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 TNNQ9UQP3 1299 aa26.46■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 UTYO14607 1347 aa26.45■■□□□ 1.83
CNDP2-204ENST00000577409 GPSM2P81274 684 aa26.45■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 SUCLG2Q96I99 432 aa26.45■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 USP44Q9H0E7 712 aa26.45■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 COL4A5P29400 1685 aa26.44■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.44■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 ITGA6P23229 1130 aa26.43■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.43■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.43■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 KIF16BQ96L93 1317 aa26.42■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.42■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 GLTPD2A6NH11 291 aa26.41■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 POLLQ9UGP5 575 aa26.41■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 TRIM27P14373 513 aa26.4■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 AOC3Q16853 763 aa26.4■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.4■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.4■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.39■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 FZD9O00144 591 aa26.39■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 KIF3CO14782 793 aa26.39■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 PPIP5K2O43314 1243 aa26.39■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.39■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CNDP2-204ENST00000577409 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.39■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.38■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.38■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.38■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.38■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.37■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.37■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.37■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.37■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.37■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.36■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.36■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 RRAGCQ9HB90 399 aa26.36■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 POTECB2RU33 542 aa26.35■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 JDP2Q8WYK2 163 aa26.35■■□□□ 1.81
CNDP2-204ENST00000577409 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms