RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), human

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPNS1-209	ENST00000567771	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
SPNS1-209	ENST00000567771	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
SPNS1-209	ENST00000567771	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SPNS1-209	ENST00000567771	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
SPNS1-209	ENST00000567771	TAF1	P21675	1872 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SPNS1-209	ENST00000567771	SCNN1D	P51172	638 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SPNS1-209	ENST00000567771	TSPYL6	Q8N831	410 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SPNS1-209	ENST00000567771	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
SPNS1-209	ENST00000567771	LTBP1	Q14766	1721 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	EPS15	P42566	896 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	TMC4	Q7Z404	712 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	MYD88	Q99836	296 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	CXCL9	Q07325	125 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	CNTROB	Q8N137	903 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	MRS2	Q9HD23	443 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SPNS1-209	ENST00000567771	COL4A1	P02462	1669 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	ANP32C	O43423	234 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	PCNT	O95613	3336 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	CNTNAP1	P78357	1384 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	RAD17	O75943	681 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	GPSM2	P81274	684 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SPNS1-209	ENST00000567771	YDJC	A8MPS7	323 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	IL16	Q14005	1332 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	WASHC4	Q2M389	1173 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	KSR2	Q6VAB6	950 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	STK31	Q9BXU1	1019 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	POLL	Q9UGP5	575 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	TNIP1	Q15025	636 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	C6orf229	H3BNL8	230 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	PDE8A	O60658	829 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	RIMBP2	O15034	1052 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	IGKV5-2	P06315	115 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	32.72	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	G2E3	Q7L622	706 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	VEGFB	P49765	207 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SPNS1-209	ENST00000567771	SLC4A2	P04920	1241 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	EYA3	Q99504	573 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	SHTN1	A0MZ66	631 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	RASSF10	A6NK89	507 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	TRAF5	O00463	557 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	DOK7	Q18PE1	504 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	PSMD14	O00487	310 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	WDR63	Q8IWG1	891 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
SPNS1-209	ENST00000567771	ECE2	O60344	883 aa		32.64	■■■□□ 2.82

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.4 ms