RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCNN1DP51172 638 aa9.28□□□□□ -0.92
CCNDBP1-212ENST00000567690 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CCNDBP1-212ENST00000567690 MPNDQ8N594 471 aa9.28□□□□□ -0.92
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYD88Q99836 296 aa9.28□□□□□ -0.92
CCNDBP1-212ENST00000567690 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.28□□□□□ -0.92
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CCNDBP1-212ENST00000567690 RAD17O75943 681 aa9.27□□□□□ -0.93
CCNDBP1-212ENST00000567690 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.932e-6■■■■□ 24.2
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CCNDBP1-212ENST00000567690 SP8Q8IXZ3 490 aa9.27□□□□□ -0.93
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSPYL6Q8N831 410 aa9.27□□□□□ -0.93
CCNDBP1-212ENST00000567690 SUPT20HQ8NEM7 779 aa9.27□□□□□ -0.93
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CCNDBP1-212ENST00000567690 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.25□□□□□ -0.93
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CCNDBP1-212ENST00000567690 IGKV5-2P06315 115 aa9.21□□□□□ -0.94
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CCNDBP1-212ENST00000567690 MICALL2Q8IY33 904 aa9.21□□□□□ -0.94
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CCNDBP1-212ENST00000567690 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.21□□□□□ -0.94
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CCNDBP1-212ENST00000567690 TRPM7Q96QT4 1865 aa9.2□□□□□ -0.94
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