RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU2-208ENST00000566637 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CTU2-208ENST00000566637 PROM2Q8N271 834 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU2-208ENST00000566637 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU2-208ENST00000566637 GPATCH3Q96I76 525 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU2-208ENST00000566637 SETDB2Q96T68 719 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU2-208ENST00000566637 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.28■■□□□ 1.64
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CTU2-208ENST00000566637 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CTU2-208ENST00000566637 NYXQ9GZU5 481 aa25.27■■□□□ 1.64
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CTU2-208ENST00000566637 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
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CTU2-208ENST00000566637 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
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CTU2-208ENST00000566637 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.24■■□□□ 1.63
CTU2-208ENST00000566637 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
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CTU2-208ENST00000566637 SDSP20132 328 aa25.22■■□□□ 1.63
CTU2-208ENST00000566637 ERFEQ4G0M1 354 aa25.22■■□□□ 1.63
CTU2-208ENST00000566637 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.22■■□□□ 1.63
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CTU2-208ENST00000566637 GPR108Q9NPR9 543 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU2-208ENST00000566637 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
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CTU2-208ENST00000566637 ZNF827Q17R98 1081 aa25.18■■□□□ 1.62
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CTU2-208ENST00000566637 EP400Q96L91 3159 aa25.12■■□□□ 1.61
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CTU2-208ENST00000566637 NLRP3Q96P20 1036 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-208ENST00000566637 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-208ENST00000566637 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.12■■□□□ 1.61
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CTU2-208ENST00000566637 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-208ENST00000566637 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-208ENST00000566637 BAG6P46379 1132 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-208ENST00000566637 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CTU2-208ENST00000566637 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTU2-208ENST00000566637 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-208ENST00000566637 SPEF2Q9C093 1822 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-208ENST00000566637 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-208ENST00000566637 A0A1B0GUL7 405 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU2-208ENST00000566637 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CTU2-208ENST00000566637 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.09■■□□□ 1.61
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