RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	CREBZF	Q9NS37	354 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	IFFO2	Q5TF58	517 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	VPS33B	Q9H267	617 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	TMC4	Q7Z404	712 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	TAF1	P21675	1872 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	TSPYL6	Q8N831	410 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	EPS15	P42566	896 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	CNTROB	Q8N137	903 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	STK31	Q9BXU1	1019 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PPP4C-208	ENST00000564966	PASK	Q96RG2	1323 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	SCNN1D	P51172	638 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	CXCL9	Q07325	125 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	C6orf229	H3BNL8	230 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	RAD17	O75943	681 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	LTBP1	Q14766	1721 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
PPP4C-208	ENST00000564966	RIMBP2	O15034	1052 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	TNIP1	Q15025	636 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	WASHC4	Q2M389	1173 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	GPSM2	P81274	684 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	KSR2	Q6VAB6	950 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	CNTNAP1	P78357	1384 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	PDE8A	O60658	829 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	EYA3	Q99504	573 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	IL16	Q14005	1332 aa		32.51	■■■□□ 2.8
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC4A2	P04920	1241 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	POLL	Q9UGP5	575 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	COL4A1	P02462	1669 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	PCNT	O95613	3336 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966		G3V3G9	751 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	YDJC	A8MPS7	323 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	DOK7	Q18PE1	504 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	VEGFB	P49765	207 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	G2E3	Q7L622	706 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	UFL1	O94874	794 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	32.46	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966		H7C1D1	291 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	TRAF5	O00463	557 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	ECE2	O60344	883 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	IGKV5-2	P06315	115 aa		32.45	■■■□□ 2.79

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