RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557636.5

TTLL5-221, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 5, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL5, Length 4,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL5-221	ENST00000557636	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	MAP3K12	Q12852	859 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	FAM227B	Q96M60	508 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	MTX1	Q13505	466 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	NLRP3	Q96P20	1036 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	TDO2	P48775	406 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	ATP10D	Q9P241	1426 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	SASH1	O94885	1247 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	PDIA6	Q15084	440 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	FAM182B	Q5T319	152 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL5-221	ENST00000557636	FIBP	O43427	364 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	ATP5J	P18859	108 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	NEK1	Q96PY6	1258 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636		H7C1W4	665 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	HAND2	P61296	217 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	TRIM29	Q14134	588 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	RAD50	Q92878	1312 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	PEAK1	Q9H792	1746 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	KCNQ4	P56696	695 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	ZNF213	O14771	459 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	KDM4A	O75164	1064 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	CTSW	P56202	376 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	KIF1A	Q12756	1690 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	CPA1	P15085	419 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	DDX11	Q96FC9	970 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	NYX	Q9GZU5	481 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	NAPB	Q9H115	298 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	NLRP10	Q86W26	655 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	BICD2	Q8TD16	824 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	MBD3	O95983	291 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	HLF	Q16534	295 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	NFAT5	O94916	1531 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	GREM2	Q9H772	168 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	AK2	P54819	239 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	NECAB1	Q8N987	351 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	PALD1	Q9ULE6	856 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	FERMT3	Q86UX7	667 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	RGS12	O14924	1447 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	HSPA4	P34932	840 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL5-221	ENST00000557636	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		11.86	□□□□□ -0.51

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