RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	SLC4A2	P04920	1241 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	GPC2	Q8N158	579 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		14.74	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		14.74	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	IGKV5-2	P06315	115 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	G2E3	Q7L622	706 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	SLC51A	Q86UW1	340 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	MPND	Q8N594	471 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	COL4A5	P29400	1685 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	PDE8A	O60658	829 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	FLII	Q13045	1269 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	TAF1	P21675	1872 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	ZNF428	Q96B54	188 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-223	ENST00000551137	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137		H7C1W4	665 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	CCER2	I3L3R5	266 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	PPIP5K2	O43314	1243 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	CHADL	Q6NUI6	762 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	NIM1K	Q8IY84	436 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	HACL1	Q9UJ83	578 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	AOC3	Q16853	763 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	LDHD	Q86WU2	507 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	LINS1	Q8NG48	757 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	GCKR	Q14397	625 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	RTL9	Q8NET4	1388 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	LTBP1	Q14766	1721 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	POTEI	P0CG38	1075 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	POTEJ	P0CG39	1038 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	EPHX2	P34913	555 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	SCNN1D	P51172	638 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	CASP7	P55210	303 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	CXCL9	Q07325	125 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	COL4A1	P02462	1669 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	CTSW	P56202	376 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	POLL	Q9UGP5	575 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137		E9PSI1	815 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	GPSM2	P81274	684 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	WASHC4	Q2M389	1173 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	KLRG1	Q96E93	195 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	PASK	Q96RG2	1323 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-223	ENST00000551137	MYH3	P11055	1940 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	CSF1R	P07333	972 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	TNIP1	Q15025	636 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	BEND3	Q5T5X7	828 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	EYA3	Q99504	573 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	YDJC	A8MPS7	323 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	EPS15	P42566	896 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	SLFN5	Q08AF3	891 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	JMY	Q8N9B5	988 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	C6orf229	H3BNL8	230 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	DPF2	Q92785	391 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	GREM2	Q9H772	168 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	CREBZF	Q9NS37	354 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137	XDH	P47989	1333 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-223	ENST00000551137		F6X3S4	739 aa		14.61	□□□□□ -0.07

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