RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa30.84■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 IGKV5-2P06315 115 aa30.83■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 TIAM2Q8IVF5 1701 aa30.83■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 PRELPP51888 382 aa30.82■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 ALDH1L2Q3SY69 923 aa30.8■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 PTPRCP08575 1304 aa30.79■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 KIF3CO14782 793 aa30.79■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 TOMM70O94826 608 aa30.79■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 GCKRQ14397 625 aa30.79■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 MPNDQ8N594 471 aa30.79■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 OLFM4Q6UX06 510 aa30.78■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 SNED1Q8TER0 1413 aa30.78■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 H7C1W4 665 aa30.77■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 RPS8P62241 208 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 CTSWP56202 376 aa30.76■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 NMRK2Q9NPI5 230 aa30.76■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 EIF6P56537 245 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 LARGE2Q8N3Y3 721 aa30.75■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 PLA2G12BQ9BX93 195 aa30.75■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 RRAGCQ9HB90 399 aa30.75■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 IQCA1LA6NCM1 817 aa30.74■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 ALDH1L1O75891 902 aa30.74■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa30.74■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa30.73■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 NIM1KQ8IY84 436 aa30.73■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.73■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 RTL9Q8NET4 1388 aa30.72■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 FZD9O00144 591 aa30.72■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 PPIP5K2O43314 1243 aa30.72■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 BEND3Q5T5X7 828 aa30.72■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 EYA3Q99504 573 aa30.71■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa30.71■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 WDR90Q96KV7 1748 aa30.7■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 F6X3S4 739 aa30.69■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 FSTL1Q12841 308 aa30.69■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.69■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 GPC2Q8N158 579 aa30.69■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 TTLL11Q8NHH1 800 aa30.69■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 SSH1Q8WYL5 1049 aa30.68■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 SMC4Q9NTJ3 1288 aa30.68■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 LRRC37AA6NMS7 1700 aa30.67■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 MYH3P11055 1940 aa30.67■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.67■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 KIAA2012Q0VF49 1180 aa30.67■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 GRM8O00222 908 aa30.66■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 PODXL2Q9NZ53 605 aa30.66■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 DDNO94850 711 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 SMC1BQ8NDV3 1235 aa30.65■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 SEC31BQ9NQW1 1179 aa30.65■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa30.65■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 CASP7P55210 303 aa30.64■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 AOC3Q16853 763 aa30.64■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 WASHC4Q2M389 1173 aa30.64■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 ZNRF3Q9ULT6 936 aa30.64■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 C6orf229H3BNL8 230 aa30.63■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 CSF1RP07333 972 aa30.62■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 GREM2Q9H772 168 aa30.62■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 GGA1Q9UJY5 639 aa30.62■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 MPHOSPH8Q99549 860 aa30.61■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 XDHP47989 1333 aa30.61■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 SCN4AP35499 1836 aa30.61■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa30.6■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 GPSM2P81274 684 aa30.6■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 TNIP1Q15025 636 aa30.6■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 KIF16BQ96L93 1317 aa30.6■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 ZNF541Q9H0D2 1346 aa30.6■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 HACL1Q9UJ83 578 aa30.6■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 TAF1P21675 1872 aa30.59■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 ITGA6P23229 1130 aa30.59■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 HSPA6P17066 643 aa30.58■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 ATP2B4P23634 1241 aa30.58■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 HDAC5Q9UQL6 1122 aa30.58■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 G3V3G9 751 aa30.57■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 DCAF8Q5TAQ9 597 aa30.57■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 TBC1D16Q8TBP0 767 aa30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms