RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532928.1

DDX25-208, Transcript of DEAD-box helicase 25, human

TSL 3

Gene DDX25, Length 726 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX25-208	ENST00000532928	DLK2	Q6UY11	383 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	ABHD8	Q96I13	439 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	YDJC	A8MPS7	323 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	SP8	Q8IXZ3	490 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	MPND	Q8N594	471 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	SCN9A	Q15858	1988 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	ECE1	P42892	770 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	TCIRG1	Q13488	830 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	GRAP	Q13588	217 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	BBOX1	O75936	387 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	FAM161A	Q3B820	660 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	FAM89A	Q96GI7	184 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	VPS33B	Q9H267	617 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDX25-208	ENST00000532928	RIMBP2	O15034	1052 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	EGFR	P00533	1210 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	MICALL2	Q8IY33	904 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	ZIC5	Q96T25	663 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	SPEF2	Q9C093	1822 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	PSMD14	O00487	310 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	CHL1	O00533	1208 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	GPSM2	P81274	684 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	TNIP1	Q15025	636 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	USP48	Q86UV5	1035 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	MAP2K2	P36507	400 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	RALBP1	Q15311	655 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	DOK7	Q18PE1	504 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	WASHC4	Q2M389	1173 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	POLL	Q9UGP5	575 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	RTL9	Q8NET4	1388 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	PSME4	Q14997	1843 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	ADM5	C9JUS6	153 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	C6orf229	H3BNL8	230 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928		H7C1D1	291 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	ECE2	O60344	883 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	HUNK	P57058	714 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	RUNDC1	Q96C34	613 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	CFAP44	Q96MT7	982 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
DDX25-208	ENST00000532928	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79

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