RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528494.5

ATG13-211, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG13, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-211ENST00000528494 TBC1D32Q96NH3 1257 aa15.53■□□□□ 0.08
ATG13-211ENST00000528494 LRRC24Q50LG9 513 aa15.53■□□□□ 0.08
ATG13-211ENST00000528494 FAM196AQ6ZSG2 479 aa15.53■□□□□ 0.08
ATG13-211ENST00000528494 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
ATG13-211ENST00000528494 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
ATG13-211ENST00000528494 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
ATG13-211ENST00000528494 BTAF1O14981 1849 aa15.52■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 PHF14O94880 888 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 GREM2Q9H772 168 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 CASC1Q6TDU7 716 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 ATG9AQ7Z3C6 839 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 TTLL11Q8NHH1 800 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 ECHDC1Q9NTX5 307 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 USPL1Q5W0Q7 1092 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 ANTXR1Q9H6X2 564 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 RPS6KA4O75676 772 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 CSF1RP07333 972 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 GPATCH3Q96I76 525 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 MAP7D2Q96T17 732 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 ITGA6P23229 1130 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 CTSWP56202 376 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 TNNI3KQ59H18 835 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 NEUROD6Q96NK8 337 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 PLA2G12BQ9BX93 195 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 NHSQ6T4R5 1651 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 SH3TC1Q8TE82 1336 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 EYA2O00167 538 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 TIMM10P62072 90 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 BOLA2Q9H3K6 86 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 NUP98P52948 1817 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 AOX1Q06278 1338 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 TTC41PQ6P2S7 1318 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 ERC2O15083 957 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 PDE8AO60658 829 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 ZPR1O75312 459 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 RXRBP28702 533 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 TBC1D9BQ66K14 1250 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 AK7Q96M32 723 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 GRPEL1Q9HAV7 217 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 IL15P40933 162 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 PARP10Q53GL7 1025 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 DBNDD2Q9BQY9 259 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 BCL2L12Q9HB09 334 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 CHMLP26374 656 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 MCM4P33991 863 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG13-211ENST00000528494 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa15.46■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 NTSR2O95665 410 aa15.46■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa15.46■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 CNTROBQ8N137 903 aa15.46■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 NARFQ9UHQ1 456 aa15.46■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 RFC4P35249 363 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 TRAPPC3LQ5T215 181 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 ERFEQ4G0M1 354 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 SBF2Q86WG5 1849 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 BRWD3Q6RI45 1802 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 SEC31BQ9NQW1 1179 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 RREB1Q92766 1687 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 TRAK2O60296 914 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 CIAO1O76071 339 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 IL25Q9H293 177 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 A0A1B0GUL7 405 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 RBM25P49756 843 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 TERF1P54274 439 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 PROM2Q8N271 834 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 SETDB2Q96T68 719 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 USP26Q9BXU7 913 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
ATG13-211ENST00000528494 METTL24Q5JXM2 366 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.5 ms