RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526493.1

UBASH3B-204, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 3

Gene UBASH3B, Length 1,163 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-204ENST00000526493 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 SH3TC1Q8TE82 1336 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 PDE8AO60658 829 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 CTSWP56202 376 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 TTLL11Q8NHH1 800 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 PLSCR1O15162 318 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 SDSP20132 328 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 TXNRD1Q16881 649 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 ATG9AQ7Z3C6 839 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 LRP5O75197 1615 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 TAF1P21675 1872 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 FAM177BA6PVY3 158 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 ZPR1O75312 459 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 TFCP2Q12800 502 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 TBC1D9BQ66K14 1250 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 PI4K2BQ8TCG2 481 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-204ENST00000526493 EYA2O00167 538 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 CDC45O75419 566 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 CIAO1O76071 339 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 AACSQ86V21 672 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 GREM2Q9H772 168 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 A0A1B0GUL6 1792 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 TTC41PQ6P2S7 1318 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 PHF14O94880 888 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 APBA3O96018 575 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 RFC4P35249 363 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 IL15P40933 162 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 LRRC24Q50LG9 513 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 FBXO3Q9UK99 471 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 ITGA6P23229 1130 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 TNNI3KQ59H18 835 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 ECHDC1Q9NTX5 307 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 RTL9Q8NET4 1388 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 SSFA2P28290 1259 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 ERFEQ4G0M1 354 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 BICDL1Q6ZP65 573 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 GPATCH3Q96I76 525 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 GPR108Q9NPR9 543 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 ARAP2Q8WZ64 1704 aa15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 ZNF609O15014 1411 aa15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 RIC1Q4ADV7 1423 aa15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 SETDB2Q96T68 719 aa15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 COL4A1P02462 1669 aa15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 NYXQ9GZU5 481 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 ABCC12Q96J65 1359 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-204ENST00000526493 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 ERC2O15083 957 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 ZNF827Q17R98 1081 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 CCDC152Q4G0S7 254 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 AKT1S1Q96B36 256 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 TBC1D32Q96NH3 1257 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 GYS1P13807 737 aa15.94■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 NFIXQ14938 502 aa15.94■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa15.94■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.94■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 RILPL2Q969X0 211 aa15.94■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 DBNDD2Q9BQY9 259 aa15.94■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.94■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.93■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 TIMM10P62072 90 aa15.93■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 SEC31BQ9NQW1 1179 aa15.93■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 AKAP11Q9UKA4 1901 aa15.92■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 ATP5JP18859 108 aa15.92■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 CHMLP26374 656 aa15.92■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 VGLL2Q8N8G2 317 aa15.92■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.92■□□□□ 0.14
UBASH3B-204ENST00000526493 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms