RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519020.5

FAM49B-210, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

TSL 5

Gene FAM49B, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49B-210ENST00000519020 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 GPC2Q8N158 579 aa20.55■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.55■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.55■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 MPNDQ8N594 471 aa20.54■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.54■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 SLC4A2P04920 1241 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 NIM1KQ8IY84 436 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 COL4A5P29400 1685 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 PPIP5K2O43314 1243 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 PDE8AO60658 829 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 HACL1Q9UJ83 578 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 LTBP1Q14766 1721 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM49B-210ENST00000519020 VAMP4O75379 141 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 CEP350Q5VT06 3117 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 FLIIQ13045 1269 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 LDHDQ86WU2 507 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 CHADLQ6NUI6 762 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 SPEF2Q9C093 1822 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 AOC3Q16853 763 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 IGKV5-2P06315 115 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 EPHX2P34913 555 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 ZNF428Q96B54 188 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 ZNF521Q96K83 1311 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 PSME4Q14997 1843 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 G2E3Q7L622 706 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 EYA3Q99504 573 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM49B-210ENST00000519020 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.45■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.45■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.45■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 RTL9Q8NET4 1388 aa20.45■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 CCER2I3L3R5 266 aa20.44■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 SLC51AQ86UW1 340 aa20.44■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.44■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 COL4A1P02462 1669 aa20.44■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 CTSWP56202 376 aa20.43■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 TNIP1Q15025 636 aa20.43■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 WASHC4Q2M389 1173 aa20.43■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 LINS1Q8NG48 757 aa20.43■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 KLRG1Q96E93 195 aa20.43■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 H7C1W4 665 aa20.42■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 GCKRQ14397 625 aa20.42■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.42■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.42■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 SCNN1DP51172 638 aa20.41■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.41■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.41■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 E9PSI1 815 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 C6orf229H3BNL8 230 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 POTEIP0CG38 1075 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 POTEJP0CG39 1038 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 GPSM2P81274 684 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 CXCL9Q07325 125 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 PASKQ96RG2 1323 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM49B-210ENST00000519020 XDHP47989 1333 aa20.39■□□□□ 0.85
FAM49B-210ENST00000519020 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.39■□□□□ 0.85
FAM49B-210ENST00000519020 CREBZFQ9NS37 354 aa20.39■□□□□ 0.85
FAM49B-210ENST00000519020 POLLQ9UGP5 575 aa20.39■□□□□ 0.85
FAM49B-210ENST00000519020 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.39■□□□□ 0.85
FAM49B-210ENST00000519020 SCN9AQ15858 1988 aa20.38■□□□□ 0.85
FAM49B-210ENST00000519020 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.38■□□□□ 0.85
FAM49B-210ENST00000519020 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
FAM49B-210ENST00000519020 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
FAM49B-210ENST00000519020 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.38■□□□□ 0.85
FAM49B-210ENST00000519020 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.38■□□□□ 0.85
FAM49B-210ENST00000519020 GGA1Q9UJY5 639 aa20.38■□□□□ 0.85
FAM49B-210ENST00000519020 JMYQ8N9B5 988 aa20.37■□□□□ 0.85
FAM49B-210ENST00000519020 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.37■□□□□ 0.85
FAM49B-210ENST00000519020 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
FAM49B-210ENST00000519020 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms