RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514556.5

CFAP99-204, Transcript of cilia and flagella associated protein 99, human

TSL 5

Gene CFAP99, Length 728 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP99-204	ENST00000514556	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CFAP99-204	ENST00000514556	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CFAP99-204	ENST00000514556	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CFAP99-204	ENST00000514556	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CFAP99-204	ENST00000514556	FSTL1	Q12841	308 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CFAP99-204	ENST00000514556	GRAP	Q13588	217 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CFAP99-204	ENST00000514556	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CFAP99-204	ENST00000514556	PSMD1	Q99460	953 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CFAP99-204	ENST00000514556	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CFAP99-204	ENST00000514556	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	FZD9	O00144	591 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	CACNA1F	O60840	1977 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	RIMBP2	O15034	1052 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	SLC4A2	P04920	1241 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	MPND	Q8N594	471 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	EPHX2	P34913	555 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	GPSM2	P81274	684 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	HACL1	Q9UJ83	578 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	SCN9A	Q15858	1988 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	SHTN1	A0MZ66	631 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	BBOX1	O75936	387 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	RAD17	O75943	681 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	EPS15	P42566	896 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	KSR2	Q6VAB6	950 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	SP8	Q8IXZ3	490 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	IL16	Q14005	1332 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556		F6X3S4	739 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	C6orf229	H3BNL8	230 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	SCNN1D	P51172	638 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	FLII	Q13045	1269 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	GPC2	Q8N158	579 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CFAP99-204	ENST00000514556	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	YDJC	A8MPS7	323 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	VAMP4	O75379	141 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	DOK7	Q18PE1	504 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	POLL	Q9UGP5	575 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	PDE8A	O60658	829 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	CXCL9	Q07325	125 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	CTSW	P56202	376 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	GREM2	Q9H772	168 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	UFL1	O94874	794 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	WASHC4	Q2M389	1173 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556		A0A1B0GUL6	1792 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	TRAF5	O00463	557 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	ECE2	O60344	883 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CFAP99-204	ENST00000514556	FAM161A	Q3B820	660 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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