RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 HYPKQ9NX55 129 aa21.99■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 ZNF853P0CG23 659 aa21.98■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.98■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 CXCL9Q07325 125 aa21.97■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 TNS4Q8IZW8 715 aa21.97■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 FAM89AQ96GI7 184 aa21.97■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 IFT57Q9NWB7 429 aa21.96■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 VEGFBP49765 207 aa21.95■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 GNAI1P63096 354 aa21.95■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.95■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 TAF1P21675 1872 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 TMC4Q7Z404 712 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.93■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 RASSF10A6NK89 507 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 RAD17O75943 681 aa21.91■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA2Q08379 1002 aa21.91■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.91■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.91■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.9■■□□□ 1.1
HERC3-211ENST00000513325 FOXN1O15353 648 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 CAPN15O75808 1086 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 YDJCA8MPS7 323 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 TRAF5O00463 557 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 TNIP1Q15025 636 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 MYD88Q99836 296 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 WASHC4Q2M389 1173 aa21.87■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 CCDC184Q52MB2 194 aa21.87■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 COL4A1P02462 1669 aa21.87■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 C6orf229H3BNL8 230 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 RIMBP2O15034 1052 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 GPSM2P81274 684 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 AIDAQ96BJ3 306 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 POLLQ9UGP5 575 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 CST9Q5W186 159 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 WBP1LQ9NX94 342 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 TSPYL6Q8N831 410 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 SHTN1A0MZ66 631 aa21.83■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.83■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.83■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
HERC3-211ENST00000513325 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 H7C1D1 291 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 PSMD14O00487 310 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 DOK7Q18PE1 504 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 MICALL2Q8IY33 904 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 CAPNS2Q96L46 248 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 EYA3Q99504 573 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 ECE2O60344 883 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 PDE8AO60658 829 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 GRM1Q13255 1194 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 DPF2Q92785 391 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC3-211ENST00000513325 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.8■■□□□ 1.08
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