RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 PDE6BP35913 854 aa25.2■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.2■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.2■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 ST5P78524 1137 aa25.19■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.19■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 RNF181Q9P0P0 153 aa25.19■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.18■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.18■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 ERFEQ4G0M1 354 aa25.18■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 KIF3CO14782 793 aa25.17■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 RASSF7Q02833 373 aa25.17■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.17■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
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SMIM20-201ENST00000506197 CASP7P55210 303 aa25.16■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.15■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 SYNE4Q8N205 404 aa25.15■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 AAMPQ13685 434 aa25.14■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 SUCLG2Q96I99 432 aa25.14■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.14■■□□□ 1.62
SMIM20-201ENST00000506197 ABCC12Q96J65 1359 aa25.14■■□□□ 1.61
SMIM20-201ENST00000506197 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.13■■□□□ 1.61
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SMIM20-201ENST00000506197 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
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SMIM20-201ENST00000506197 SLX4Q8IY92 1834 aa25.12■■□□□ 1.61
SMIM20-201ENST00000506197 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.12■■□□□ 1.61
SMIM20-201ENST00000506197 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.12■■□□□ 1.61
SMIM20-201ENST00000506197 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.12■■□□□ 1.61
SMIM20-201ENST00000506197 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.11■■□□□ 1.61
SMIM20-201ENST00000506197 LMNB1P20700 586 aa25.1■■□□□ 1.61
SMIM20-201ENST00000506197 NLRP3Q96P20 1036 aa25.1■■□□□ 1.61
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SMIM20-201ENST00000506197 SRGNP10124 158 aa25.09■■□□□ 1.61
SMIM20-201ENST00000506197 CTSWP56202 376 aa25.09■■□□□ 1.61
SMIM20-201ENST00000506197 STYK1Q6J9G0 422 aa25.09■■□□□ 1.61
SMIM20-201ENST00000506197 CNKSR1Q969H4 720 aa25.09■■□□□ 1.61
SMIM20-201ENST00000506197 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SMIM20-201ENST00000506197 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.09■■□□□ 1.61
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SMIM20-201ENST00000506197 MASTLQ96GX5 879 aa25.08■■□□□ 1.61
SMIM20-201ENST00000506197 KAZALD1Q96I82 304 aa25.08■■□□□ 1.61
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SMIM20-201ENST00000506197 C21orf2O43822 256 aa25.07■■□□□ 1.6
SMIM20-201ENST00000506197 FOXO4P98177 505 aa25.07■■□□□ 1.6
SMIM20-201ENST00000506197 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.07■■□□□ 1.6
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SMIM20-201ENST00000506197 HSPA6P17066 643 aa25.06■■□□□ 1.6
SMIM20-201ENST00000506197 PRELPP51888 382 aa25.06■■□□□ 1.6
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SMIM20-201ENST00000506197 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.04■■□□□ 1.6
SMIM20-201ENST00000506197 CSF1RP07333 972 aa25.03■■□□□ 1.6
SMIM20-201ENST00000506197 NPR1P16066 1061 aa25.03■■□□□ 1.6
SMIM20-201ENST00000506197 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SMIM20-201ENST00000506197 CEP85Q6P2H3 762 aa25.03■■□□□ 1.6
SMIM20-201ENST00000506197 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.03■■□□□ 1.6
SMIM20-201ENST00000506197 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
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SMIM20-201ENST00000506197 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SMIM20-201ENST00000506197 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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SMIM20-201ENST00000506197 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.02■■□□□ 1.6
SMIM20-201ENST00000506197 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SMIM20-201ENST00000506197 SPEF2Q9C093 1822 aa25.02■■□□□ 1.6
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SMIM20-201ENST00000506197 MTX1Q13505 466 aa25.01■■□□□ 1.59
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.01■■□□□ 1.59
SMIM20-201ENST00000506197 FAM161AQ3B820 660 aa25.01■■□□□ 1.59
SMIM20-201ENST00000506197 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.01■■□□□ 1.59
SMIM20-201ENST00000506197 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.01■■□□□ 1.59
SMIM20-201ENST00000506197 TAF1P21675 1872 aa25■■□□□ 1.59
SMIM20-201ENST00000506197 HMMRO75330 724 aa25■■□□□ 1.59
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SMIM20-201ENST00000506197 RTL9Q8NET4 1388 aa25■■□□□ 1.59
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SMIM20-201ENST00000506197 RRAGCQ9HB90 399 aa24.99■■□□□ 1.59
SMIM20-201ENST00000506197 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.99■■□□□ 1.59
SMIM20-201ENST00000506197 GLTPD2A6NH11 291 aa24.98■■□□□ 1.59
SMIM20-201ENST00000506197 ITGA6P23229 1130 aa24.98■■□□□ 1.59
SMIM20-201ENST00000506197 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.98■■□□□ 1.59
SMIM20-201ENST00000506197 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SMIM20-201ENST00000506197 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SMIM20-201ENST00000506197 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.97■■□□□ 1.59
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