RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 FSHRP23945 695 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 GYS2P54840 703 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 XKR5Q6UX68 686 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 TICAM2Q86XR7 235 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 HOMER1Q86YM7 354 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 SMC5Q8IY18 1101 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 LILRB2Q8N423 598 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 JDP2Q8WYK2 163 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 WNT2BQ93097 391 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 BCS1LQ9Y276 419 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 TBX4P57082 545 aa6.61□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 RELL1Q8IUW5 271 aa6.61□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.61□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 PMM1Q92871 262 aa6.61□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 CNKSR1Q969H4 720 aa6.61□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.61□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.61□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.61□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 TMEM260Q9NX78 707 aa6.61□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 CABP1Q9NZU7 370 aa6.61□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.6□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 GSTT1P30711 240 aa6.6□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 MASP1P48740 699 aa6.6□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.6□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 ODR4Q5SWX8 454 aa6.6□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.6□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.6□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 TMEM74Q96NL1 305 aa6.6□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 CDK15Q96Q40 435 aa6.6□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 DNAJC7Q99615 494 aa6.6□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.59□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 F6X3S4 739 aa6.59□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 MICAL2O94851 1124 aa6.59□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 MAP3K10Q02779 954 aa6.59□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.59□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.59□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 FEZ1Q99689 392 aa6.59□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 MTRQ99707 1265 aa6.59□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 IER2Q9BTL4 223 aa6.59□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.59□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 CNTN3Q9P232 1028 aa6.59□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.59□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 PHACTR2O75167 634 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 S1PR4O95977 384 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 GARTP22102 1010 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 GRM5P41594 1212 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 SQSTM1Q13501 440 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 GRM2Q14416 872 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 ARID5BQ14865 1188 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 TNNI3KQ59H18 835 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 FERMT3Q86UX7 667 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 SGSM3Q96HU1 749 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 SHDQ96IW2 340 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 RHOVQ96L33 236 aa6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 POTEB3A0JP26 581 aa6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 PRC1O43663 620 aa6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 GREM1O60565 184 aa6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 SKOR1P84550 965 aa6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 RASGRF1Q13972 1273 aa6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 POTEBQ6S5H4 581 aa6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 STAC3Q96MF2 364 aa6.57□□□□□ -1.36
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